RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 DLG1Q12959 904 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 SH2D4BQ5SQS7 431 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 TSTD2Q5T7W7 516 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 PIK3R6Q5UE93 754 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 MARC1Q5VT66 337 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 GLB1LQ6UWU2 654 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 CCNYL1Q8N7R7 359 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 HEXDCQ8WVB3 486 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 OMDQ99983 421 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 KLHL4Q9C0H6 718 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 RRAGCQ9HB90 399 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM248Q9NWD8 314 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 PDP2Q9P2J9 529 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 AIM2O14862 343 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 EOMESO95936 686 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 PEX11BO96011 259 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 RBP1P09455 135 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 TBX4P57082 545 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 RPL26P61254 145 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 TNK2Q07912 1038 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF460Q14592 562 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 KDM1BQ8NB78 822 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 TRIB2Q92519 343 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 ZBTB26Q9HCK0 441 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 FCGRTP55899 365 aa19.73■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 PEX6Q13608 980 aa19.73■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 SLC14A2Q15849 920 aa19.73■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 KCNA10Q16322 511 aa19.73■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 NXNQ6DKJ4 435 aa19.73■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 PDSS2Q86YH6 399 aa19.73■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 DSELQ8IZU8 1212 aa19.73■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa19.73■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 SHKBP1Q8TBC3 707 aa19.73■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 EFCAB1Q9HAE3 211 aa19.73■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 NOD1Q9Y239 953 aa19.73■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 SLC7A4O43246 635 aa19.72■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 PEX1O43933 1283 aa19.72■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 CHRNA4P43681 627 aa19.72■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 CCR10P46092 362 aa19.72■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 CRHR2Q13324 411 aa19.72■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 PCSK7Q16549 785 aa19.72■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 TRIM67Q6ZTA4 783 aa19.72■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF683Q8IZ20 524 aa19.72■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 PGAM4Q8N0Y7 254 aa19.72■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 CEP70Q8NHQ1 597 aa19.72■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 ATXN3LQ9H3M9 355 aa19.72■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 POMKQ9H5K3 350 aa19.72■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 NT5MQ9NPB1 228 aa19.72■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 IGSF5Q9NSI5 407 aa19.72■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 NUDT5Q9UKK9 219 aa19.72■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 CTGFP29279 349 aa19.72■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 SLC26A3P40879 764 aa19.72■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 PSMD5Q16401 504 aa19.72■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 TECRLQ5HYJ1 363 aa19.72■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 OR52E8Q6IFG1 317 aa19.72■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 RGMBQ6NW40 437 aa19.72■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 CNSTQ6PJW8 725 aa19.72■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 KDELC2Q7Z4H8 507 aa19.72■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 TEX26Q8N6G2 289 aa19.72■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 KLHDC9Q8NEP7 349 aa19.72■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 SP110Q9HB58 689 aa19.72■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa19.71■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 OR4Q2P0C623 313 aa19.71■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 MAGEA11P43364 429 aa19.71■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 PGGT1BP53609 377 aa19.71■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 PFKPQ01813 784 aa19.71■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 DSC1Q08554 894 aa19.71■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 LAMB3Q13751 1172 aa19.71■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 ZFP1Q6P2D0 407 aa19.71■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 SLC22A9Q8IVM8 553 aa19.71■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 MOCOSQ96EN8 888 aa19.71■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 HMCESQ96FZ2 354 aa19.71■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 RGS18Q9NS28 235 aa19.71■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 RAG1P15918 1043 aa19.71■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 CST5P28325 142 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 ITKQ08881 620 aa19.71■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 CSHL1Q14406 222 aa19.71■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 ACAP2Q15057 778 aa19.71■□□□□ 0.75
SPNS1-201ENST00000311008 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms