RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000305264.7

HDAC3-201, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDAC3, Length 1,959 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-201ENST00000305264 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
HDAC3-201ENST00000305264 EFCAB8A8MWE9 144 aa27.4■■□□□ 1.98
HDAC3-201ENST00000305264 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
HDAC3-201ENST00000305264 IL1BP01584 269 aa27.4■■□□□ 1.98
HDAC3-201ENST00000305264 PRNPP04156 253 aa27.4■■□□□ 1.98
HDAC3-201ENST00000305264 GEMP55040 296 aa27.4■■□□□ 1.98
HDAC3-201ENST00000305264 WNT3AP56704 352 aa27.4■■□□□ 1.98
HDAC3-201ENST00000305264 SATB1Q01826 763 aa27.4■■□□□ 1.98
HDAC3-201ENST00000305264 MPP3Q13368 585 aa27.4■■□□□ 1.98
HDAC3-201ENST00000305264 SLC14A2Q15849 920 aa27.4■■□□□ 1.98
HDAC3-201ENST00000305264 TEX35Q5T0J7 233 aa27.4■■□□□ 1.98
HDAC3-201ENST00000305264 KCTD11Q693B1 232 aa27.4■■□□□ 1.98
HDAC3-201ENST00000305264 GDPD4Q6W3E5 623 aa27.4■■□□□ 1.98
HDAC3-201ENST00000305264 KDELC2Q7Z4H8 507 aa27.4■■□□□ 1.98
HDAC3-201ENST00000305264 DSG4Q86SJ6 1040 aa27.4■■□□□ 1.98
HDAC3-201ENST00000305264 EPHX3Q9H6B9 360 aa27.4■■□□□ 1.98
HDAC3-201ENST00000305264 APRTP07741 180 aa27.39■■□□□ 1.98
HDAC3-201ENST00000305264 RPL21P46778 160 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
HDAC3-201ENST00000305264 SPARCL1Q14515 664 aa27.39■■□□□ 1.98
HDAC3-201ENST00000305264 GRM3Q14832 879 aa27.39■■□□□ 1.98
HDAC3-201ENST00000305264 TMIEQ8NEW7 156 aa27.39■■□□□ 1.98
HDAC3-201ENST00000305264 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
HDAC3-201ENST00000305264 CPT1BQ92523 772 aa27.39■■□□□ 1.98
HDAC3-201ENST00000305264 LRIG1Q96JA1 1093 aa27.39■■□□□ 1.98
HDAC3-201ENST00000305264 KLHL32Q96NJ5 620 aa27.39■■□□□ 1.98
HDAC3-201ENST00000305264 DPH5Q9H2P9 285 aa27.39■■□□□ 1.98
HDAC3-201ENST00000305264 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
HDAC3-201ENST00000305264 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa27.39■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 E7EVH7 732 aa27.39■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 SOCS5O75159 536 aa27.39■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 DGKEP52429 567 aa27.39■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 ANKRD22Q5VYY1 191 aa27.39■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 DUPD1Q68J44 220 aa27.39■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 ZSWIM9Q86XI8 627 aa27.39■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa27.39■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa27.39■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 SUV39H2Q9H5I1 410 aa27.39■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 FBRSQ9HAH7 460 aa27.39■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 CHKBQ9Y259 395 aa27.39■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 SNX24Q9Y343 169 aa27.39■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 AP2A1O95782 977 aa27.38■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 PDHA1P08559 390 aa27.38■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 RPS14P62263 151 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 KCNJ11Q14654 390 aa27.38■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 TMPRSS6Q8IU80 811 aa27.38■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 LRRC45Q96CN5 670 aa27.38■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 HHIPQ96QV1 700 aa27.38■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 RAB17Q9H0T7 212 aa27.38■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 TNFRSF10AO00220 468 aa27.37■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 USP12O75317 370 aa27.37■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 RHOXF2BP0C7M4 288 aa27.37■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 NDUFV2P19404 249 aa27.37■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 CST6Q15828 149 aa27.37■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 IZUMO3Q5VZ72 239 aa27.37■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 PBXIP1Q96AQ6 731 aa27.37■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 ECHDC3Q96DC8 303 aa27.37■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 SNF8Q96H20 258 aa27.37■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 MRGPRX1Q96LB2 322 aa27.37■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 TRIB3Q96RU7 358 aa27.37■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 APOL2Q9BQE5 337 aa27.37■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 RHOXF2Q9BQY4 288 aa27.37■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 FICDQ9BVA6 458 aa27.37■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 FSD1LQ9BXM9 530 aa27.37■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa27.37■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 ESYT3A0FGR9 886 aa27.37■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 GOLGA6CA6NDK9 693 aa27.37■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 GOLGA6BA6NDN3 693 aa27.37■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa27.37■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 PRLP01236 227 aa27.37■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 GOLGA6DP0CG33 693 aa27.37■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 GABRG2P18507 467 aa27.37■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 MAGEA9P43362 315 aa27.37■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 CLCN5P51795 746 aa27.37■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 TRADDQ15628 312 aa27.37■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 HMGB4Q8WW32 186 aa27.37■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 ARRDC3Q96B67 414 aa27.37■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa27.37■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 MID1O15344 667 aa27.36■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 FZD6O60353 706 aa27.36■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 TMEM63AO94886 807 aa27.36■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 PGLSO95336 258 aa27.36■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 AGTP01019 485 aa27.36■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 ADRA1AP35348 466 aa27.36■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 LMAN1P49257 510 aa27.36■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 GUCY2DQ02846 1103 aa27.36■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 CDK18Q07002 472 aa27.36■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 ZNF805Q5CZA5 627 aa27.36■■□□□ 1.97
HDAC3-201ENST00000305264 IER2Q9BTL4 223 aa27.36■■□□□ 1.97
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