RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299259.10

COPS2-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS2, Length 2,036 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2-201ENST00000299259 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 GOLGA8TH3BQL2 631 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 ZNF197O14709 1029 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 TIMM44O43615 452 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 VAPBO95292 243 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 NDST3O95803 873 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 CD160O95971 181 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 ALADP13716 330 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 CEBPBP17676 345 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 ARNTP27540 789 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 SPRP35270 261 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 PBX2P40425 430 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 RHOAP61586 193 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 PDE1BQ01064 536 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 LMAN2Q12907 356 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 USP4Q13107 963 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 ZNF77Q15935 545 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 CNGA3Q16281 694 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 PDK4Q16654 411 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 QPCTQ16769 361 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 TSTD2Q5T7W7 516 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 RETSATQ6NUM9 610 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 RNF135Q8IUD6 432 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 CNTN4Q8IWV2 1026 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 LRRC34Q8IZ02 419 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 TRIB3Q96RU7 358 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 FAM167BQ9BTA0 163 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 CERS4Q9HA82 394 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 LHX3Q9UBR4 397 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 GRID1Q9ULK0 1009 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 SCN8AQ9UQD0 1980 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 CEP290O15078 2479 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 TRANK1O15050 2925 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 SERPINB8P50452 374 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 LAMB3Q13751 1172 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 UGP2Q16851 508 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 FYB2Q5VWT5 728 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 FOXR1Q6PIV2 292 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 NLRP9Q7RTR0 991 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 APCDD1Q8J025 514 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 NDUFAF2Q8N183 169 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 FIBINQ8TAL6 211 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 ING5Q8WYH8 240 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 ACDQ96AP0 544 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 VPS39Q96JC1 886 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 FAM111AQ96PZ2 611 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 TLE6Q9H808 572 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 PIDD1Q9HB75 910 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 MROH6A6NGR9 719 aa10.59□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 SIN3BO75182 1162 aa10.59□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 F7P08709 466 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 DHRS4L1P0CG22 281 aa10.59□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 FOXN2P32314 431 aa10.59□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 CD70P32970 193 aa10.59□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 ETV4P43268 484 aa10.59□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP10.59□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 DUSP6Q16828 381 aa10.59□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 PLEKHG6Q3KR16 790 aa10.59□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 PPP2R2DQ66LE6 453 aa10.59□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 ZNF470Q6ECI4 717 aa10.59□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 FSTL4Q6MZW2 842 aa10.59□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 RGS9BPQ6ZS82 235 aa10.59□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa10.59□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 DCLK2Q8N568 766 aa10.59□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa10.59□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 LRRC8CQ8TDW0 803 aa10.59□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 GDPD5Q8WTR4 605 aa10.59□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 ISL2Q96A47 359 aa10.59□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 MCMBPQ9BTE3 642 aa10.59□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 PBX4Q9BYU1 374 aa10.59□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 SLC13A1Q9BZW2 595 aa10.59□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 LMAN2LQ9H0V9 348 aa10.59□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 RHOJQ9H4E5 214 aa10.59□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 SNX15Q9NRS6 342 aa10.59□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP10.59□□□□□ -0.712e-7■■■■□ 22.6
COPS2-201ENST00000299259 TBC1D14Q9P2M4 693 aa10.59□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 GGT7Q9UJ14 662 aa10.59□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 CLEC4EQ9ULY5 219 aa10.59□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 CHKBQ9Y259 395 aa10.59□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 GLRA3O75311 464 aa10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms