RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297316.4

SOX17-201, Transcript of SRY-box 17, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOX17, Length 2,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17-201ENST00000297316 CCL26Q9Y258 94 aa21.58■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa21.58■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 USH1CQ9Y6N9 552 aa21.58■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 BPGMP07738 259 aa21.57■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 MAGEA12P43365 314 aa21.57■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 RGRP47804 291 aa21.57■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 OXCT1P55809 520 aa21.57■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 BST1Q10588 318 aa21.57■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 CHI3L2Q15782 390 aa21.57■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 SHKBP1Q8TBC3 707 aa21.57■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 ISL2Q96A47 359 aa21.57■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 MUC3BQ9H195 1237 aa21.57■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 MYLK2Q9H1R3 596 aa21.57■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 TCAF1Q9Y4C2 921 aa21.57■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 ILVBLA1L0T0 632 aa21.57■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 AP3B1O00203 1094 aa21.57■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 KLF11O14901 512 aa21.57■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 SNAP91O60641 907 aa21.57■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 GSTA1P08263 222 aa21.57■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 TYK2P29597 1187 aa21.57■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 PGGT1BP53609 377 aa21.57■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 NTHL1P78549 312 aa21.57■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 BNIP1Q12981 228 aa21.57■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 LINGO4Q6UY18 593 aa21.57■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa21.57■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 C20orf27Q9GZN8 174 aa21.57■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 HELZP42694 1942 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 H0Y626 953 aa21.56■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 KDELR3O43731 214 aa21.56■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 GABRB3P28472 473 aa21.56■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 SPRP35270 261 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 NCALDP61601 193 aa21.56■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 SLC7A9P82251 487 aa21.56■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 TNK2Q07912 1038 aa21.56■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 SLC5A9Q2M3M2 681 aa21.56■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 NUDCD3Q8IVD9 361 aa21.56■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 RIN3Q8TB24 985 aa21.56■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 E2F7Q96AV8 911 aa21.56■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 ANKRD36A6QL64 1941 aa21.56■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa21.56■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 GFRA2O00451 464 aa21.56■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 GLRA3O75311 464 aa21.56■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 RASSF9O75901 435 aa21.56■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 CDC25CP30307 473 aa21.56■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 FYB2Q5VWT5 728 aa21.56■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 TPGS1Q6ZTW0 290 aa21.56■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 KCNK13Q9HB14 408 aa21.56■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 TMEM216Q9P0N5 145 aa21.56■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 CLEC4EQ9ULY5 219 aa21.56■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 C5orf67F2Z3F1 127 aa21.55■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 PLIN3O60664 434 aa21.55■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 MOSPD3O75425 235 aa21.55■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 VAPBO95292 243 aa21.55■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 TMPRSS15P98073 1019 aa21.55■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 SEPT6Q14141 434 aa21.55■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 TEAD2Q15562 447 aa21.55■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 GPR158Q5T848 1215 aa21.55■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 PDPK2PQ6A1A2 396 aa21.55■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 TADA1Q96BN2 335 aa21.55■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 ERP27Q96DN0 273 aa21.55■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 GCNAQ96QF7 691 aa21.55■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 SLC40A1Q9NP59 571 aa21.55■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa21.55■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 LEFTY2O00292 366 aa21.55■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 ARF5P84085 180 aa21.55■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 IRF9Q00978 393 aa21.55■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 SHHQ15465 462 aa21.55■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 CNGA3Q16281 694 aa21.55■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 POTEHQ6S545 545 aa21.55■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 NLRP9Q7RTR0 991 aa21.55■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 DENND6AQ8IWF6 608 aa21.55■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 VPS39Q96JC1 886 aa21.55■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 ECT2Q9H8V3 914 aa21.55■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 KLC4Q9NSK0 619 aa21.55■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 MYO9BQ13459 2157 aa21.54■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa21.54■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 LATS1O95835 1130 aa21.54■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 CD160O95971 181 aa21.54■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 PBX2P40425 430 aa21.54■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 SERPINB8P50452 374 aa21.54■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 MPP1Q00013 466 aa21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.6 ms