RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL1Q9NR64 748 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 ATP6V1HQ9UI12 483 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 XYLBO75191 536 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 MTA2O94776 668 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 OTCP00480 354 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 NTSP30990 170 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 POLD2P49005 469 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 MAPK10P53779 464 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 IL31RAQ8NI17 732 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 CDH19Q9H159 772 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PPM1 405 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 AZIN1O14977 448 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 MFN2O95140 757 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 LCA5LO95447 670 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 BPGMP07738 259 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 EPHA3P29320 983 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 GRM5P41594 1212 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 CRATP43155 626 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 CYP20A1Q6UW02 462 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 C10orf107Q8IVU9 208 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 NDNQ99608 321 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 PCDH18Q9HCL0 1135 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 PSME2Q9UL46 239 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 QSOX1O00391 747 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 IDO1P14902 403 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 ITGA2P17301 1181 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 SPIRE1Q08AE8 756 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 ECM1Q16610 540 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 SPESP1Q6UW49 350 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 IL6P05231 212 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 NOMO1Q15155 1222 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 COPS5Q92905 334 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 GMPPBQ9Y5P6 360 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 AHCYL1O43865 530 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 VGLL4Q14135 290 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 GINS4Q9BRT9 223 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 BTBD3Q9Y2F9 522 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 HES2Q9Y543 173 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 MROH1Q8NDA8 1641 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 BUD23O43709 281 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 CES1P23141 567 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 RFX4Q33E94 735 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 HGSNATQ68CP4 663 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 STRADAQ7RTN6 431 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 TNS4Q8IZW8 715 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 DHRS12A0PJE2 317 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 RGS21Q2M5E4 152 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA0408Q6ZU52 694 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 DEFB132Q7Z7B7 95 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 DEPDC4Q8N2C3 294 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 CERS5Q8N5B7 392 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 KREMEN1Q96MU8 473 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHB18PQ96TA0 734 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 RHOJQ9H4E5 214 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 NTRK1P04629 796 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 CDC25CP30307 473 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 KCTD21Q4G0X4 260 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 OFCC1Q8IZS5 231 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 SLC44A1Q8WWI5 657 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 ELMO1Q92556 727 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 CD101Q93033 1021 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 PRDM4Q9UKN5 801 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 ADM5C9JUS6 153 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 PGM3O95394 542 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 FGF1P05230 155 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 USP46P62068 366 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 ITGADQ13349 1161 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 FBXL19Q6PCT2 694 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 GCNT7Q6ZNI0 430 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 TOP6BLQ8N6T0 577 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 CDYL2Q8N8U2 506 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 MYDGFQ969H8 173 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 Q96MT0 163 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 JAK1P23458 1154 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 BRMS1LQ5PSV4 323 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 P2RY11Q96G91 374 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 RTKNQ9BST9 563 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 DERAQ9Y315 318 aa21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.1 ms