RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277657.12

CCDC7-201, Transcript of coiled-coil domain containing 7, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC7, Length 1,899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7-201ENST00000277657 PLLPQ9Y342 182 aa22.28■■□□□ 1.16
CCDC7-201ENST00000277657 GOLGA8TH3BQL2 631 aa22.28■■□□□ 1.16
CCDC7-201ENST00000277657 TPP1O14773 563 aa22.28■■□□□ 1.16
CCDC7-201ENST00000277657 TMCC1O94876 653 aa22.28■■□□□ 1.16
CCDC7-201ENST00000277657 MAGEA12P43365 314 aa22.28■■□□□ 1.16
CCDC7-201ENST00000277657 TSTD2Q5T7W7 516 aa22.28■■□□□ 1.16
CCDC7-201ENST00000277657 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CCDC7-201ENST00000277657 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CCDC7-201ENST00000277657 BHMTQ93088 406 aa22.28■■□□□ 1.16
CCDC7-201ENST00000277657 FAM111AQ96PZ2 611 aa22.28■■□□□ 1.16
CCDC7-201ENST00000277657 PCMTD2Q9NV79 361 aa22.28■■□□□ 1.16
CCDC7-201ENST00000277657 DPP7Q9UHL4 492 aa22.28■■□□□ 1.16
CCDC7-201ENST00000277657 EBAG9O00559 213 aa22.27■■□□□ 1.16
CCDC7-201ENST00000277657 PER2O15055 1255 aa22.27■■□□□ 1.16
CCDC7-201ENST00000277657 NDST3O95803 873 aa22.27■■□□□ 1.16
CCDC7-201ENST00000277657 SCNN1BP51168 640 aa22.27■■□□□ 1.16
CCDC7-201ENST00000277657 PDE1BQ01064 536 aa22.27■■□□□ 1.16
CCDC7-201ENST00000277657 FSTL4Q6MZW2 842 aa22.27■■□□□ 1.16
CCDC7-201ENST00000277657 LINGO4Q6UY18 593 aa22.27■■□□□ 1.16
CCDC7-201ENST00000277657 NLRP9Q7RTR0 991 aa22.27■■□□□ 1.16
CCDC7-201ENST00000277657 FIBINQ8TAL6 211 aa22.27■■□□□ 1.16
CCDC7-201ENST00000277657 RIN3Q8TB24 985 aa22.27■■□□□ 1.16
CCDC7-201ENST00000277657 ATP2A3Q93084 1043 aa22.27■■□□□ 1.16
CCDC7-201ENST00000277657 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CCDC7-201ENST00000277657 SEC16BQ96JE7 1060 aa22.27■■□□□ 1.16
CCDC7-201ENST00000277657 EXOC2Q96KP1 924 aa22.27■■□□□ 1.16
CCDC7-201ENST00000277657 SLC13A1Q9BZW2 595 aa22.27■■□□□ 1.16
CCDC7-201ENST00000277657 SCUBE2Q9NQ36 999 aa22.27■■□□□ 1.16
CCDC7-201ENST00000277657 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa22.27■■□□□ 1.16
CCDC7-201ENST00000277657 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CCDC7-201ENST00000277657 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa22.27■■□□□ 1.16
CCDC7-201ENST00000277657 TIMM44O43615 452 aa22.26■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 DCLK2Q8N568 766 aa22.26■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 TDP1Q9NUW8 608 aa22.26■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 LHX3Q9UBR4 397 aa22.26■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 GGA2Q9UJY4 613 aa22.26■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 NTHL1P78549 312 aa22.26■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 TPGS1Q6ZTW0 290 aa22.26■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 APCDD1Q8J025 514 aa22.26■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 OR13J1Q8NGT2 312 aa22.26■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 ZMYM5Q9UJ78 669 aa22.26■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 CLEC4EQ9ULY5 219 aa22.26■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 TRANK1O15050 2925 aa22.25■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 LDB2O43679 373 aa22.25■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 PEX13Q92968 403 aa22.25■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 ACDQ96AP0 544 aa22.25■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 RHOJQ9H4E5 214 aa22.25■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 PLK2Q9NYY3 685 aa22.25■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 CYBBP04839 570 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 F7P08709 466 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 GABRB3P28472 473 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 LMAN2Q12907 356 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 LAMB3Q13751 1172 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 GALNT3Q14435 633 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 UGP2Q16851 508 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 ZNF697Q5TEC3 545 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 LRRC8CQ8TDW0 803 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 SPOCK2Q92563 424 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 VPS39Q96JC1 886 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 LMLNQ96KR4 655 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 FAM167BQ9BTA0 163 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 SNX15Q9NRS6 342 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 GGT7Q9UJ14 662 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 PRAMEF12O95522 483 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 PRLP01236 227 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 AHSGP02765 367 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 TCF3P15923 654 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 TYK2P29597 1187 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 HADHAP40939 763 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 SERPINB8P50452 374 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 PLK1P53350 603 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 ACVR1Q04771 509 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 RALGPS1Q5JS13 557 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 RETSATQ6NUM9 610 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 RNF135Q8IUD6 432 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 BRSK1Q8TDC3 778 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 PTPRN2Q92932 1015 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 GPR22Q99680 433 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 RIMKLBQ9ULI2 386 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CCDC7-201ENST00000277657 ZNF197O14709 1029 aa22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms