RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000275036.11

HMGN3-201, Transcript of high mobility group nucleosomal binding domain 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3, Length 831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-201ENST00000275036 FTSJ1Q9UET6 329 aa14.62□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 ARHGAP42A6NI28 874 aa14.61□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 SDC3O75056 442 aa14.61□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 PIGNO95427 931 aa14.61□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 ITGAVP06756 1048 aa14.61□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 THEGLP0DJG4 465 aa14.61□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 ITIH2P19823 946 aa14.61□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 AMPD1P23109 780 aa14.61□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 RPS21P63220 83 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 TRIM14Q14142 442 aa14.61□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 SLC18A3Q16572 532 aa14.61□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 BOLA3Q53S33 107 aa14.61□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa14.61□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 OR8K1Q8NGG5 319 aa14.61□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 CSPG4P5Q96PW8 444 aa14.61□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 CHP1Q99653 195 aa14.61□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa14.61□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 SLC17A9Q9BYT1 436 aa14.61□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 PCDH18Q9HCL0 1135 aa14.61□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 DONSONQ9NYP3 566 aa14.61□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 IP6K2Q9UHH9 426 aa14.61□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 FAM149AA5PLN7 773 aa14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 TMEM8BA6NDV4 472 aa14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 IGLON5A6NGN9 336 aa14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 H3BRJ5 948 aa14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 DFFAO00273 331 aa14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 AREL1O15033 823 aa14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 TIMP2P16035 220 aa14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 ADKP55263 362 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 OVGP1Q12889 678 aa14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 CCDC157Q569K6 752 aa14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 TPRG1LQ5T0D9 272 aa14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 DHRS13Q6UX07 377 aa14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 TEKT4Q8WW24 435 aa14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 TSC1Q92574 1164 aa14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 RAB7BQ96AH8 199 aa14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 KLHDC7BQ96G42 594 aa14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 FEM1CQ96JP0 617 aa14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 BMFQ96LC9 184 aa14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 NSMCE3Q96MG7 304 aa14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 GPR27Q9NS67 375 aa14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 ABHD10Q9NUJ1 306 aa14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 UCKL1Q9NWZ5 548 aa14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 MYLKQ15746 1914 aa14.59□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa14.59□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 POM121BA6NF01 834 aa14.59□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 MYO1FO00160 1098 aa14.59□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 ENC1O14682 589 aa14.59□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 MUSKO15146 869 aa14.59□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 YKT6O15498 198 aa14.59□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 TSPAN6O43657 245 aa14.59□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 MFAP3LO75121 409 aa14.59□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 CD48P09326 243 aa14.59□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 GIMD1P0DJR0 217 aa14.59□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 IL4RP24394 825 aa14.59□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 AKT2P31751 481 aa14.59□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 ACADVLP49748 655 aa14.59□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 RAD51Q06609 339 aa14.59□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 MMRN1Q13201 1228 aa14.59□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 INAVAQ3KP66 663 aa14.59□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa14.59□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 ZSWIM9Q86XI8 627 aa14.59□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 SLC25A45Q8N413 288 aa14.59□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa14.59□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 DKK3Q9UBP4 350 aa14.59□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HMGN3-201ENST00000275036 TSPAN11A1L157 253 aa14.58□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 TRIM38O00635 465 aa14.58□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 MAGEC1O60732 1142 aa14.58□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 PALMO75781 387 aa14.58□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 PEX11BO96011 259 aa14.58□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 ARL4AP40617 200 aa14.58□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 ARSEP51690 589 aa14.58□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 TAS2R40P59535 323 aa14.58□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 IL10RBQ08334 325 aa14.58□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 SLC10A7Q0GE19 358 aa14.58□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 CAMK2BQ13554 666 aa14.58□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 SRLQ86TD4 932 aa14.58□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 TTC7BQ86TV6 843 aa14.58□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 CAMK1DQ8IU85 385 aa14.58□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 OXR1Q8N573 874 aa14.58□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 LZTR1Q8N653 840 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms