RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262426.5

FOXF1-201, Transcript of forkhead box F1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXF1, Length 3,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1-201ENST00000262426 C6orf183Q5T699 404 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 CLNKQ7Z7G1 428 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 DENND1AQ8TEH3 1009 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 ZYG11BQ9C0D3 744 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 KLHL4Q9C0H6 718 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 LZTS1Q9Y250 596 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 BUD23O43709 281 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 PRKCGP05129 697 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 ACVR1CQ8NER5 493 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 DPF3Q92784 378 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 CAB39LQ9H9S4 337 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 NELFEP18615 380 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 GJA8P48165 433 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 DSC2Q02487 901 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 C1orf146Q5VVC0 180 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 TXNDC8Q6A555 127 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 OR7D4Q8NG98 312 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 BTN2A3PQ96KV6 586 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 ANKRD27Q96NW4 1050 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 INIPQ9NRY2 104 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 ZNF358Q9NW07 568 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 NDE1Q9NXR1 346 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 IL37Q9NZH6 218 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 FAM92AA1XBS5 289 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 ZNF840PA6NDX5 716 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 SOD2P04179 222 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 PIRTP0C851 137 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 PRKCHP24723 683 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 EPHB1P54762 984 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 SEPT6Q14141 434 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 KCTD11Q693B1 232 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 MSANTD2Q6P1R3 559 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 IYDQ6PHW0 289 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 CMC1Q7Z7K0 106 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 BANPQ8N9N5 519 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 ECSITQ9BQ95 431 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 FAM192AQ9GZU8 254 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 ACSS2Q9NR19 701 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 MOCS1Q9NZB8 636 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 BFARQ9NZS9 450 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 PCDHGB4Q9UN71 923 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 YIPF1Q9Y548 306 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 B2RBV5 119 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 TEX28O15482 410 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 ALDH1A3P47895 512 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 DLG1Q12959 904 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 CDC16Q13042 620 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 DLG2Q15700 870 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 GRAMD1BQ3KR37 738 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 GRAMD4Q6IC98 578 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 BEND5Q7L4P6 421 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 ZNF683Q8IZ20 524 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 NDUFAF2Q8N183 169 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 SLC39A11Q8N1S5 342 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 ZBED2Q9BTP6 218 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 MATN3O15232 486 aa14.62□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 TIMP1P01033 207 aa14.62□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 CCNCP24863 283 aa14.62□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 CD86P42081 329 aa14.62□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 C4orf22Q6V702 233 aa14.62□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 SMIM14Q96QK8 99 aa14.62□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 ARMC7Q9H6L4 198 aa14.62□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 SP110Q9HB58 689 aa14.62□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 GLOD4Q9HC38 313 aa14.62□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa14.62□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 RFPL1O75677 317 aa14.62□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 VARSP26640 1264 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 PCSK6P29122 969 aa14.62□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 ZXDBP98169 803 aa14.62□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 OCRLQ01968 901 aa14.62□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 BTBD10Q9BSF8 475 aa14.62□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 FSD1LQ9BXM9 530 aa14.62□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 PLK2Q9NYY3 685 aa14.62□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 A0A0U1RQS6 177 aa14.62□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 FAM159BA6NKW6 160 aa14.62□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 POLBP06746 335 aa14.62□□□□□ -0.07
FOXF1-201ENST00000262426 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms