RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 CDH6P55285 790 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 RPL26P61254 145 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 TAF5Q15542 800 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 TREML1Q86YW5 311 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 ACMSDQ8TDX5 336 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 EDEM1Q92611 657 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
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CAPNS1-201ENST00000246533 SOX13Q9UN79 622 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
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CAPNS1-201ENST00000246533 KLHL2O95198 593 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 GPD1P21695 349 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 STX3Q13277 289 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 BOLA3Q53S33 107 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM110Q86TL2 294 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
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CAPNS1-201ENST00000246533 F5P12259 2224 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 AQP5P55064 265 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF220Q5VTB9 566 aa26.67■■□□□ 1.86
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CAPNS1-201ENST00000246533 EMC1Q8N766 993 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 GSDMBQ8TAX9 411 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM4Q9C037 500 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 CNGB3Q9NQW8 809 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM159BA6NKW6 160 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 BSPRYQ5W0U4 402 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 MFSD6LQ8IWD5 586 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 SH3RF2Q8TEC5 729 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 PANX3Q96QZ0 392 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 ETNK2Q9NVF9 386 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 WASF2Q9Y6W5 498 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 HELZP42694 1942 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 WDFY4Q6ZS81 3184 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 DLL1O00548 723 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 DCXO43602 365 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 PRPSAP2O60256 369 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 LYNP07948 512 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 PSMC3P17980 439 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 TPSB2P20231 275 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 WEE1P30291 646 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 MAGEA3P43357 314 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 TPSAB1Q15661 275 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 C1orf146Q5VVC0 180 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
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CAPNS1-201ENST00000246533 SLC7A8Q9UHI5 535 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 SDR42E2A6NKP2 422 aa26.65■■□□□ 1.86
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CAPNS1-201ENST00000246533 DESP17661 470 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 GDI1P31150 447 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 IRX4P78413 519 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 ZXDAP98168 799 aa26.65■■□□□ 1.86
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CAPNS1-201ENST00000246533 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 DUSP12Q9UNI6 340 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC7A9P82251 487 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 TNK2Q07912 1038 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 KRT81Q14533 505 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 C10orf120Q5SQS8 335 aa26.64■■□□□ 1.86
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CAPNS1-201ENST00000246533 PLD5Q8N7P1 536 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 RILPQ96NA2 401 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 LEFTY2O00292 366 aa26.63■■□□□ 1.85
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF77Q15935 545 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
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CAPNS1-201ENST00000246533 BPIFB1Q8TDL5 484 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-201ENST00000246533 OLFM3Q96PB7 478 aa26.63■■□□□ 1.85
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CAPNS1-201ENST00000246533 CLIC5Q9NZA1 410 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-201ENST00000246533 KLHL33A6NCF5 533 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-201ENST00000246533 C2CD4BA6NLJ0 364 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-201ENST00000246533 SOBPA7XYQ1 873 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-201ENST00000246533 GRAP2O75791 330 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-201ENST00000246533 CPA2P48052 419 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-201ENST00000246533 KDSRQ06136 332 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-201ENST00000246533 EFEMP1Q12805 493 aa26.63■■□□□ 1.85
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