RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000244360.6

RNF39-201, Transcript of ring finger protein 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RNF39, Length 2,206 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39-201ENST00000244360 CNTN5O94779 1100 aa22.12■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 IGLV3-27P01718 113 aa22.12■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 STMN1P16949 149 aa22.12■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 YWHAQP27348 245 aa22.12■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 CD151P48509 253 aa22.12■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 SP3Q02447 781 aa22.12■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 ASPHQ12797 758 aa22.12■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 EFEMP1Q12805 493 aa22.12■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 PSMD5Q16401 504 aa22.12■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 ALFQ53S48 1182 aa22.12■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 RNF220Q5VTB9 566 aa22.12■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 ZNF470Q6ECI4 717 aa22.12■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 PDSS2Q86YH6 399 aa22.12■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 ZFAND2BQ8WV99 257 aa22.12■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 TADA1Q96BN2 335 aa22.12■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 SH3GL3Q99963 347 aa22.12■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
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RNF39-201ENST00000244360 ATXN3LQ9H3M9 355 aa22.12■■□□□ 1.13
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RNF39-201ENST00000244360 FBXO5Q9UKT4 447 aa22.12■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 HEATR9A2RTY3 570 aa22.11■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 J3KR12 359 aa22.11■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 MMP2P08253 660 aa22.11■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
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RNF39-201ENST00000244360 SAT1P21673 171 aa22.11■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 AVPR1AP37288 418 aa22.11■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 RALGPS1Q5JS13 557 aa22.11■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 ZNF280DQ6N043 979 aa22.11■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 ACAD11Q709F0 780 aa22.11■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 MAPK15Q8TD08 544 aa22.11■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 RTKNQ9BST9 563 aa22.11■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 NT5MQ9NPB1 228 aa22.11■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 SRRDQ9UH36 339 aa22.11■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 CEP350Q5VT06 3117 aa22.11■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 DRGXA6NNA5 263 aa22.11■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 MATN2O00339 956 aa22.11■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 GRIA4P48058 902 aa22.11■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 PGGT1BP53609 377 aa22.11■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 EPHB1P54762 984 aa22.11■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 CCNIQ14094 377 aa22.11■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 SEPT6Q14141 434 aa22.11■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa22.11■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 NEPROQ6NW34 567 aa22.11■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 MFN1Q8IWA4 741 aa22.11■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 FBXW8Q8N3Y1 598 aa22.11■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 SLC26A7Q8TE54 656 aa22.11■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 FBXO32Q969P5 355 aa22.11■■□□□ 1.13
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RNF39-201ENST00000244360 SLC10A7Q0GE19 358 aa22.1■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 DLG1Q12959 904 aa22.1■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 PCSK7Q16549 785 aa22.1■■□□□ 1.13
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RNF39-201ENST00000244360 FBXL22Q6P050 247 aa22.1■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 DEFB107AQ8IZN7 70 aa22.1■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 GALNT15Q8N3T1 639 aa22.1■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 IGSF8Q969P0 613 aa22.1■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 SCYL1Q96KG9 808 aa22.1■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 KLHL4Q9C0H6 718 aa22.1■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 A0A087X1B8 175 aa22.1■■□□□ 1.13
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RNF39-201ENST00000244360 TSTD2Q5T7W7 516 aa22.1■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 FAM171A1Q5VUB5 890 aa22.1■■□□□ 1.13
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RNF39-201ENST00000244360 XPR1Q9UBH6 696 aa22.1■■□□□ 1.13
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RNF39-201ENST00000244360 ZNF460Q14592 562 aa22.09■■□□□ 1.13
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RNF39-201ENST00000244360 GALNT7Q86SF2 657 aa22.09■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 PHTF2Q8N3S3 785 aa22.09■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 GPR152Q8TDT2 470 aa22.09■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 NXNL1Q96CM4 212 aa22.09■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 ELMO2Q96JJ3 720 aa22.09■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 KLHL5Q96PQ7 755 aa22.09■■□□□ 1.13
RNF39-201ENST00000244360 GPR62Q9BZJ7 368 aa22.09■■□□□ 1.13
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