RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cep57Q8CEE0 500 aa17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gmpr2Q99L27 348 aa17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tbk1Q9WUN2 729 aa17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Arih2Q9Z1K6 492 aa17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm6370A0A0G2JGX9 315 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wdr49A0A0N4SUK7 710 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm5485A0A1D5RM98 91 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm3259D3YUK0 475 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Grip2G3XA20 1042 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm6309L7N481 315 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atoh1P48985 351 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Psme3P61290 254 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Muc1Q02496 630 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Arhgap17Q3UIA2 846 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hspa1aQ61696 641 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MafkQ61827 156 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam181bQ80VF6 417 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Best2Q8BGM5 508 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sfrp1Q8C4U3 314 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adgrg3Q8R0T6 542 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ppp6r2Q8R3Q2 923 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PclafQ9CQX4 110 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tspan3Q9QY33 253 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm44511A0A0N4SW10 223 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc16a6B1AT66 607 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm21293E9Q4G9 266 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn2r5K7N788 911 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Got2P05202 430 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tlx1P43345 332 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AurkaP97477 395 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mef2dQ63943 514 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Scd4Q6T707 353 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1037Q7TR84 321 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tgm6Q8BM11 706 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam163bQ8BUM6 167 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nol6Q8R5K4 1152 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tbc1d19Q8VDV7 526 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lrrc4Q99PH1 652 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spata1Q9D5R4 444 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trpc4Q9QUQ5 974 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trpc7Q9WVC5 862 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ankrd34aB2RW11 495 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cldn5O54942 218 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MylpfP97457 169 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam83fQ3UKU4 495 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Glp2rQ5IXF8 512 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm5431Q5NCB3 844 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr463Q5SW49 311 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr462Q5SW50 311 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cspg5Q71M36 566 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ttc34Q8C0Q3 554 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Grsf1Q8C5Q4 479 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MiosQ8VE19 875 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pcdhb11Q91UZ8 797 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ppa2Q91VM9 330 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mat2bQ99LB6 334 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rgs10Q9CQE5 181 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Retreg3Q9CQV4 466 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mmp19Q9JHI0 527 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cngb3Q9JJZ9 694 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rnf11Q9QYK7 154 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cdh22Q9WTP5 813 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nrf1Q9WU00 503 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm6509A0A0J9YUV1 481 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn1r2A2AMT6 306 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mtx3D3YTP3 312 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm8113E0CXS8 587 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cntnap3E9PY62 1287 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm6351K9J7D1 481 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atn1O35126 1175 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 P01652 108 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PtprcP06800 1291 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gdf6P43028 454 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rpl36P47964 105 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trim67Q505D9 768 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ssxb3Q6XAS4 170 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr867Q7TRF3 331 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rnf38Q8BI21 518 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spdye4bQ8CDE8 236 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ppp4r1Q8K2V1 951 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc30a5Q8R4H9 761 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 GneQ91WG8 722 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nipsnap3bQ9CQE1 247 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MecrQ9DCS3 373 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ptk2bQ9QVP9 1009 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cyhr1Q9QXA1 311 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adam17Q9Z0F8 827 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf106O88466 1888 aa17.21■□□□□ 0.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm5751A2AHC8 147 aa17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ssxb8B1AY40 170 aa17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Camk4P08414 469 aa17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Jak1P52332 1153 aa17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Clec4fP70194 548 aa17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adra1dP97714 562 aa17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SelpQ01102 768 aa17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam171bQ14CH0 825 aa17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lsmem1Q3UQS2 128 aa17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dyrk2Q5U4C9 599 aa17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1062Q7TR71 315 aa17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dhx33Q80VY9 698 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 42 ms