RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638372.1

SCARB2-208, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

TSL 5

Gene SCARB2, Length 4,811 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-208ENST00000638372 STK40Q8N2I9 435 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 ROGDIQ9GZN7 287 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 SPG21Q9NZD8 308 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 SPEF2Q9C093 1822 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 CCL22O00626 93 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 COX4I1P13073 169 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 PFKPQ01813 784 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 NRF1Q16656 503 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 FAM45BPQ6NSW5 357 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 FAM45AQ8TCE6 357 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 SPPL2AQ8TCT8 520 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 MAGED4Q96JG8 741 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 TTPALQ9BTX7 342 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 NMUR2Q9GZQ4 415 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 RHOJQ9H4E5 214 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 SELENONQ9NZV5 590 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 PLLPQ9Y342 182 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 RAP2CQ9Y3L5 183 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 SNX8Q9Y5X2 465 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 ABCC6O95255 1503 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 PTPN9P43378 593 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 NCALDP61601 193 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 FBXL18Q96ME1 805 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 GMLQ99445 158 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 TRPC4Q9UBN4 977 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 ARL5CA6NH57 179 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 APOA1P02647 267 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 GRK3P35626 688 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 RANBP1P43487 201 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 TP53BP2Q13625 1128 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 USP45Q70EL2 814 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 GPR141Q7Z602 305 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 OOSP2Q86WS3 158 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 BBS7Q8IWZ6 715 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 SELENOMQ8WWX9 145 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 COMMD8Q9NX08 183 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 KDM1AO60341 852 aa14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 LDLRP01130 860 aa14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 SLC16A1P53985 500 aa14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 IRF8Q02556 426 aa14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 ACSM2AQ08AH3 577 aa14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 LIPMQ5VYY2 423 aa14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 ACSM2BQ68CK6 577 aa14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 RFWD3Q6PCD5 774 aa14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 FBXL19Q6PCT2 694 aa14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 ZNF621Q6ZSS3 439 aa14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 ZNF567Q8N184 647 aa14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 DNAJB14Q8TBM8 379 aa14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 SPPL2BQ8TCT7 592 aa14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 PHACTR1Q9C0D0 580 aa14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 ZFP14Q9HCL3 533 aa14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 DPP7Q9UHL4 492 aa14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 SORCS3Q9UPU3 1222 aa14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 PEX1O43933 1283 aa14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 HGFP14210 728 aa14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 LPOP22079 712 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 RAD23AP54725 363 aa14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 ARHGAP1Q07960 439 aa14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 ZBTB17Q13105 803 aa14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 CCL14Q16627 93 aa14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 ZDHHC24Q6UX98 284 aa14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 ASB2Q96Q27 587 aa14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 SDCBP2Q9H190 292 aa14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 RNF39Q9H2S5 420 aa14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 TBC1D3BA6NDS4 549 aa14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 CLOCKO15516 846 aa14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 XYLBO75191 536 aa14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 S100A5P33763 92 aa14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 TTPAP49638 278 aa14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 SEMA5AQ13591 1074 aa14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 RHBDF2Q6PJF5 856 aa14.47□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 BRI3BPQ8WY22 251 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms