RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623267.3

SNHG5-216, Transcript of small nucleolar RNA host gene 5, humanhuman

TSL 5

Gene SNHG5, Length 374 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG5-216ENST00000623267 SNX10Q9Y5X0 201 aa5.76□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 IRAK3Q9Y616 596 aa5.76□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 COMMD10Q9Y6G5 202 aa5.76□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 CAPN7Q9Y6W3 813 aa5.76□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 ANK1P16157 1881 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 J3KR12 359 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 TPP1O14773 563 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 PLIN3O60664 434 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 DNAJC6O75061 913 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 USP12O75317 370 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 STC2O76061 302 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 FGF18O76093 207 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 CNTN5O94779 1100 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 GJB5O95377 273 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 GLUD1P00367 558 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 OAS1P00973 400 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 PENKP01210 267 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 C1QAP02745 245 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 AHSGP02765 367 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 F11P03951 625 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 C2P06681 752 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 PYGLP06737 847 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 MYL2P10916 166 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 RALBP11234 206 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 CSF2RAP15509 400 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 PTPN2P17706 415 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 ATF6P18850 670 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 BMPR1AP36894 532 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 AVPR1AP37288 418 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 NNMTP40261 264 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 SCTRP47872 440 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 CSNK1DP48730 415 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 SCNN1BP51168 640 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 KCNQ1P51787 676 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 PTPN5P54829 565 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 RAB10P61026 200 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 AP1S1P61966 158 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 CRADDP78560 199 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 SLC7A9P82251 487 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 FPGSQ05932 587 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 SLC10A7Q0GE19 358 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 BNIP1Q12981 228 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 CDH18Q13634 790 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 SEPT6Q14141 434 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 POU6F1Q14863 301 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 KRT72Q14CN4 511 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.493e-7■■■■■ 70.6
SNHG5-216ENST00000623267 ACAP2Q15057 778 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 CHI3L2Q15782 390 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 CNGA3Q16281 694 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 ALFQ53S48 1182 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 FSCBQ5H9T9 825 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 C6orf163Q5TEZ5 329 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 DENND5AQ6IQ26 1287 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 UGT3A1Q6NUS8 523 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 KDELC1Q6UW63 502 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 OTOAQ7RTW8 1153 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 CPXM2Q8N436 756 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 DCLK2Q8N568 766 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 SLC25A41Q8N5S1 370 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 PAF1Q8N7H5 531 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 GPR150Q8NGU9 434 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 DDI1Q8WTU0 396 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 INPP5DQ92835 1189 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 TADA1Q96BN2 335 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 KLHL29Q96CT2 875 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 RMDN1Q96DB5 314 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 OTUB2Q96DC9 234 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 NSL1Q96IY1 281 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 FAR2Q96K12 515 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 RILPQ96NA2 401 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 SAMD11Q96NU1 681 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 TMEM237Q96Q45 408 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 GPR22Q99680 433 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 SEMA3CQ99985 751 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 MGME1Q9BQP7 344 aa5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SNHG5-216ENST00000623267 ATXN3LQ9H3M9 355 aa5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms