RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617185.4

TP53-222, Transcript of tumor protein p53, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene TP53, Length 2,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TP53-222	ENST00000617185	ZFP90	Q8TF47	636 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	CNDP1	Q96KN2	507 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	PSKH2	Q96QS6	385 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	POLE4	Q9NR33	117 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	CCNK	O75909	580 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	MFN2	O95140	757 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	LYPLA2	O95372	231 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	GSR	P00390	522 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	BMP2	P12643	396 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	ETFB	P38117	255 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	DPP6	P42658	865 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	NUMB	P49757	651 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	BMPR2	Q13873	1038 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	SNX17	Q15036	470 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	MAPK11	Q15759	364 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	STXBP2	Q15833	593 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	FAXC	Q5TGI0	409 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	EPGN	Q6UW88	154 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	GLRX5	Q86SX6	157 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	SULF1	Q8IWU6	871 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	COPS5	Q92905	334 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	MAP6	Q96JE9	813 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	ZNF560	Q96MR9	790 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	IL12RB2	Q99665	862 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	COG4	Q9H9E3	785 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	GMIP	Q9P107	970 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	ISPD	A4D126	451 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	IL18RAP	O95256	599 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	TNNI1	P19237	187 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	GLDC	P23378	1020 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	PTGS2	P35354	604 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	TNK2	Q07912	1038 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	EMC2	Q15006	297 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	DUSP7	Q16829	419 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	NXN	Q6DKJ4	435 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	SV2A	Q7L0J3	742 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	MFSD4A	Q8N468	514 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	DCLK2	Q8N568	766 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	HDAC11	Q96DB2	347 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	MAGED4	Q96JG8	741 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	ZNF302	Q9NR11	478 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	ZNF221	Q9UK13	617 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	CSAD	Q9Y600	493 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	PTPRJ	Q12913	1337 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185		C9IYK1	514 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	SLC22A2	O15244	555 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	AVIL	O75366	819 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	ARIH2	O95376	493 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	KRT1	P04264	644 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	CAPN1	P07384	714 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TP53-222	ENST00000617185	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54

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