RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC25A3Q00325 362 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 NECAB2Q7Z6G3 386 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC44A1Q8WWI5 657 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 ACBD6Q9BR61 282 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 PLK2Q9NYY3 685 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 SNX8Q9Y5X2 465 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 RUNX1T1Q06455 604 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 SMARCB1Q12824 385 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 BBS2Q9BXC9 721 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 VPS45Q9NRW7 570 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 LRIG2O94898 1065 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 ARHGAP1Q07960 439 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 MFSD4BQ5TF39 518 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 OR6Y1Q8NGX8 325 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 SELENOMQ8WWX9 145 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 PMM2O15305 246 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 TPSB2P20231 275 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 GABRB2P47870 512 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 TPSAB1Q15661 275 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 DET1Q7L5Y6 550 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 ELMO1Q92556 727 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 GMLQ99445 158 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 CHKBQ9Y259 395 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 VWA7Q9Y334 891 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 LRRC37A3O60309 1634 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 EDF1O60869 148 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 ZMPSTE24O75844 475 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 C2P06681 752 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 LRPAP1P30533 357 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 RRM2P31350 389 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 S100A3P33764 101 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 ASPAP45381 313 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 CREMQ03060 361 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 OASLQ15646 514 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 GDPD5Q8WTR4 605 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 RHOJQ9H4E5 214 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 LIMD1Q9UGP4 676 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 C10orf107Q8IVU9 208 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 OR4L1Q8NH43 312 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 SPPL2AQ8TCT8 520 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 RNF145Q96MT1 663 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 GNPTGQ9UJJ9 305 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 RAP2CQ9Y3L5 183 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 BIRC5O15392 142 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 CXCL14O95715 111 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 GLUD2P49448 558 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 ANKRD22Q5VYY1 191 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 OR6K2Q8NGY2 324 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 NEK3P51956 506 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 TGM3Q08188 693 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 FNBP1LQ5T0N5 605 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 MFSD5Q6N075 450 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 MTSS1LQ765P7 747 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 CPNE8Q86YQ8 564 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 RSPH1Q8WYR4 309 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 ATP6AP2O75787 350 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 PIGRP01833 764 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC16A1P53985 500 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 MAB21L3Q8N8X9 362 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 MAGED4Q96JG8 741 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM79Q9BSE2 394 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 BDH2Q9BUT1 245 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM155BO75949 473 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 EPHA3P29320 983 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 GPR15P49685 360 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 LIPMQ5VYY2 423 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 ARPINQ7Z6K5 226 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 MYH2Q9UKX2 1941 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 CLDN11O75508 207 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 CLPTM1O96005 669 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 LDLRP01130 860 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 KCNJ2P63252 427 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 PYDC1Q8WXC3 89 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 MINDY3Q9H8M7 445 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 GGA2Q9UJY4 613 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 CCL14Q16627 93 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 PIK3R5Q8WYR1 880 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 CYLDQ9NQC7 956 aa20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms