RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607772.5

CNKSR3-205, Transcript of CNKSR family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNKSR3, Length 21,063 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR3-205ENST00000607772 NDUFAF1Q9Y375 327 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 CLTBP09497 229 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 C1orf189Q5VU69 101 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 CLNKQ7Z7G1 428 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 CES3Q6UWW8 571 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 USP43Q70EL4 1123 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 LHFPL3Q86UP9 236 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 LRRC71Q8N4P6 559 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 GATAD2BQ8WXI9 593 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 PTPN7P35236 360 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 GSTM5P46439 218 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 RBP5P82980 135 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 P2RY8Q86VZ1 359 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 LINC00116Q8NCU8 138 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 ACER1Q8TDN7 264 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 GAL3ST3Q96A11 431 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 ITGA11Q9UKX5 1188 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 PSME3P61289 254 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 BIRC8Q96P09 236 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 SLITRK2Q9H156 845 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 ANKRA2Q9H9E1 313 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 GDAP2Q9NXN4 497 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 DNAJB4Q9UDY4 337 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 SLC37A4O43826 429 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 TM7SF2O76062 418 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 CHRNGP07510 517 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 GPD1P21695 349 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 MUC3BQ9H195 1237 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 UNC13BO14795 1591 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 MYBPC1Q00872 1141 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 PTPAQ15257 358 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 TIGD4Q8IY51 512 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 ZNF570Q96NI8 536 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 CLCA2Q9UQC9 943 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 CYP2C8P10632 490 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 HSD17B4P51659 736 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 TNK2Q07912 1038 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 MAP3K14Q99558 947 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 YIPF2Q9BWQ6 316 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 RBP1P09455 135 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 IL18Q14116 193 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 ULK3Q6PHR2 472 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 STARD8Q92502 1023 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 EPB41L4BQ9H329 900 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 CAPN10Q9HC96 672 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 STARD7Q9NQZ5 370 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 RAD18Q9NS91 495 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 LIMD1Q9UGP4 676 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 FAM25EA8MYX2 175 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 APOL2Q9BQE5 337 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 CD93Q9NPY3 652 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 UBP1Q9NZI7 540 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 PRAMEF10O60809 474 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 THEGLP0DJG4 465 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 IL7P13232 177 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 CLCA1A8K7I4 914 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 CPB1P15086 417 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 CYP11B1P15538 503 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 SOX10P56693 466 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 DEF8Q6ZN54 512 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 TNIP3Q96KP6 325 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 CLN6Q9NWW5 311 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 IRGMA1A4Y4 181 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 RGS10O43665 173 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 TIE1P35590 1138 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 AADATQ8N5Z0 425 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 SNAP29O95721 258 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 STIP1P31948 543 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 CDC42P60953 191 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 LEMD2Q8NC56 503 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 ERLEC1Q96DZ1 483 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 ZNF350Q9GZX5 532 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 MAF1Q9H063 256 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 LRRC42Q9Y546 428 aa7.12□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 C1orf196B1AJZ1 125 aa7.11□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 ERCC2P18074 760 aa7.11□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 VPS72Q15906 364 aa7.11□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 PIM2Q9P1W9 311 aa7.11□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 SH3PXD2BA1X283 911 aa7.11□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 TSTD3H0UI37 97 aa7.11□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 PRAMEF1O95521 474 aa7.11□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 PEPDP12955 493 aa7.11□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 FBXO36Q8NEA4 188 aa7.11□□□□□ -1.27
CNKSR3-205ENST00000607772 EXD2Q9NVH0 621 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.1 ms