RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607707.1

SNORD11B-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 11B, humanhuman

BASIC

Gene SNORD11B, Length 90 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD11B-201ENST00000607707 CDC25AP30304 524 aa2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 GGT5P36269 586 aa2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 LIFRP42702 1097 aa2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 TUBP50607 506 aa2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 CLDN2P57739 230 aa2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 ADORA2A-AS1P86434 159 aa2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 CAPSQ13938 189 aa2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 ERV3-1Q14264 604 aa2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 LPIN1Q14693 890 aa2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 SHBQ15464 509 aa2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 HSPB2Q16082 182 aa2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 NFIL3Q16649 462 aa2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 EDRF1Q3B7T1 1238 aa2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 FSCBQ5H9T9 825 aa2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 SLC22A25Q6T423 547 aa2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 FAM160B2Q86V87 743 aa2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 CHD1LQ86WJ1 897 aa2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 DENND6AQ8IWF6 608 aa2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 MIGA1Q8NAN2 632 aa2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 TNIP2Q8NFZ5 429 aa2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 PPM1EQ8WY54 764 aa2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 YME1L1Q96TA2 773 aa2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 AGXT2Q9BYV1 514 aa2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 WASH6PQ9NQA3 447 aa2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 SNTG1Q9NSN8 517 aa2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 ANKRD10Q9NXR5 420 aa2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 KIAA1456Q9P272 454 aa2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 PEMTQ9UBM1 199 aa2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 HSPB7Q9UBY9 170 aa2.26□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 EVPLQ92817 2033 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 ARHGAP10A1A4S6 786 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 LACTBL1A8MY62 500 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 PROB1E7EW31 1015 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 J3KR12 359 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 CHL1O00533 1208 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 TIMM23O14925 209 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 KLK8O60259 260 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 HOXC6P09630 235 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 NAGAP17050 411 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 ITGB6P18564 788 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 ITGAXP20702 1163 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 AMTP48728 403 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 PCYT1AP49585 367 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 CLCN5P51795 746 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 NUDT6P53370 316 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 CDH15P55291 814 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 ZXDBP98169 803 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 GRIK3Q13003 919 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 TRAF3Q13114 568 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 GPR68Q15743 365 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 BAK1Q16611 211 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 ESCO2Q56NI9 601 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 NCAPH2Q6IBW4 605 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 TMEM81Q6P7N7 255 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 MON1BQ7L1V2 547 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 HEATR4Q86WZ0 1026 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 PALB2Q86YC2 1186 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 LURAP1LQ8IV03 231 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 SFTPA2Q8IWL1 248 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 ESX1Q8N693 406 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 IL17REQ8NFR9 667 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 ARRDC2Q8TBH0 407 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 NEUROG1Q92886 237 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 SNAPC3Q92966 411 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 HVCN1Q96D96 273 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 PHF21BQ96EK2 531 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 APOPT1Q96IL0 206 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 TMEM204Q9BSN7 226 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 HEMGNQ9BXL5 484 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 HIPK2Q9H2X6 1198 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 TMEM51Q9NW97 253 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 HIF1ANQ9NWT6 349 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 HCN3Q9P1Z3 774 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD11B-201ENST00000607707 IL36RNQ9UBH0 155 aa2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms