RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 CENPTQ96BT3 561 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 WBP1Q96G27 269 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC46A1Q96NT5 459 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 BOCQ9BWV1 1114 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 SPASTQ9UBP0 616 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAI1Q9UI46 699 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 NEU3Q9UQ49 428 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 SSUH2Q9Y2M2 353 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 KRIT1O00522 736 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 MUSKO15146 869 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 UGT2B4P06133 528 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 SKOR1P84550 965 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 VAC14Q08AM6 782 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 PRRT3Q5FWE3 981 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC73Q5JTD7 316 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC35F3Q8IY50 421 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 PHACTR4Q8IZ21 702 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 MLKLQ8NB16 471 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2AP1Q8NGE2 309 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 BTN2A2Q8WVV5 523 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC61Q9BV99 259 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGEB5Q9BZ81 275 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 OR12D3Q9UGF7 316 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 DOCK4Q8N1I0 1966 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 CFAP46Q8IYW2 2715 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM72CH0Y354 149 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 AREL1O15033 823 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 GSRP00390 522 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 ETFBP38117 255 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 MAPKAPK2P49137 400 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 ADKP55263 362 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 CDO1Q16878 200 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM72AQ5TYM5 149 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM72DQ6L9T8 149 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 VPS36Q86VN1 386 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM72BQ86X60 149 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 MSANTD4Q8NCY6 345 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 EPS8L1Q8TE68 723 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC9Q92623 222 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 GRAMD1AQ96CP6 724 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHL32Q96NJ5 620 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM248Q9NWD8 314 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 RHOQP17081 205 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 ADRA1BP35368 520 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 THOP1P52888 689 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 PDX1P52945 283 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 MYLK3Q32MK0 819 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM114A1Q8IWE2 563 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 TPCN2Q8NHX9 752 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF462Q96JM2 2506 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 ATMQ13315 3056 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 CAPN8A6NHC0 703 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 CDRT15L2A8MXV6 281 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 F8VZ95 297 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 TCEA3O75764 348 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 UCHL3P15374 230 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 LY6DQ14210 128 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 PTK2BQ14289 1009 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC14Q49A88 953 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXR1Q6PIV2 292 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC20A1Q8WUM9 679 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 RXFP2Q8WXD0 754 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGEF26Q96DR7 871 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 CLPBQ9H078 707 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGEH1Q9H213 219 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 LMO7DNF2Z398 122 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 J3QKU1 62 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 MMP20O60882 483 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 LRIG2O94898 1065 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 POP4O95707 220 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 ITIH2P19823 946 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 RPIAP49247 311 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 ARL13BQ3SXY8 428 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC7BQ86TV6 843 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 JOSD2Q8TAC2 188 aa25.99■■□□□ 1.75
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