RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 OVCA2Q8WZ82 227 aa11.85□□□□□ -0.51
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CAPNS1-209ENST00000590049 SYT10Q6XYQ8 523 aa11.82□□□□□ -0.52
CAPNS1-209ENST00000590049 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
CAPNS1-209ENST00000590049 NIPA2Q8N8Q9 360 aa11.82□□□□□ -0.52
CAPNS1-209ENST00000590049 TEX19Q8NA77 164 aa11.82□□□□□ -0.52
CAPNS1-209ENST00000590049 TTC13Q8NBP0 860 aa11.82□□□□□ -0.52
CAPNS1-209ENST00000590049 OR4C6Q8NH72 309 aa11.82□□□□□ -0.52
CAPNS1-209ENST00000590049 EDEM1Q92611 657 aa11.82□□□□□ -0.52
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