RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 ITGB7P26010 798 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 RGRP47804 291 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 MARCKSL1P49006 195 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 RENBPP51606 427 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 ADPRHP54922 357 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 TAS2R38P59533 333 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 MAXP61244 160 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 GBE1Q04446 702 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF235Q14590 738 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF805Q5CZA5 627 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRC73Q5JTD7 316 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 MARC1Q5VT66 337 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 AGBL4Q5VU57 503 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 C11orf63Q6NUN7 778 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC23A3Q6PIS1 610 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 CAMK1DQ8IU85 385 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 TXLNBQ8N3L3 684 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 PGBD5Q8N414 524 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 ATPAF2Q8N5M1 289 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 PAF1Q8N7H5 531 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 PLD5Q8N7P1 536 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 CEP76Q8TAP6 659 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 KRT35Q92764 455 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 FAF2Q96CS3 445 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 LRIG1Q96JA1 1093 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 FEM1CQ96JP0 617 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF599Q96NL3 588 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 HEMGNQ9BXL5 484 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 HDAC8Q9BY41 377 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 PCED1AQ9H1Q7 454 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 SUV39H2Q9H5I1 410 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 NT5MQ9NPB1 228 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 DTLQ9NZJ0 730 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 SEPT3Q9UH03 358 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 AMFRQ9UKV5 643 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC6A14Q9UN76 642 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM131Q92545 1883 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 PI4KAP42356 2102 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 VPS13AQ96RL7 3174 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRK1Q38SD2 2015 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A1B0GTW7 788 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A1W2PPC4 97 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A1W2PQU0 124 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 GRID2IPA4D2P6 1211 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 A8MX80 341 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 NEMP1O14524 444 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 KCNK3O14649 394 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 WNT9AO14904 365 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 MATN3O15232 486 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC31A1O15431 190 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC7A4O43246 635 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 PSTPIP1O43586 416 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 KRT86O43790 486 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 NRDCO43847 1150 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 NEBLO76041 1014 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 FTCDO95954 541 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 PEX11BO96011 259 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 JCHAINP01591 159 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 IGHV4-34P06331 123 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 SERPINF2P08697 491 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 ADRB3P13945 408 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 CCNB1P14635 433 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 XPAP23025 273 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 CD27P26842 260 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 GARSP41250 739 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 DPP6P42658 865 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 CDKN2BP42772 138 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 MMP13P45452 471 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 MAPK8P45983 427 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 CSNK1DP48730 415 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 PEX5P50542 639 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 CCR5P51681 352 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 NEK3P51956 506 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 PPP2CBP62714 309 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 PPP2CAP67775 309 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 CCZ1BP86790 482 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms