RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569341.1

CFDP1-208, Transcript of craniofacial development protein 1, human

TSL 3

Gene CFDP1, Length 454 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CFDP1-208	ENST00000569341	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	CCDC89	Q8N998	374 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	RDM1	Q8NG50	284 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	ZNF398	Q8TD17	642 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	SHC3	Q92529	594 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	INPP5D	Q92835	1189 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	GJA10	Q969M2	543 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	SNF8	Q96H20	258 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	ZNF778	Q96MU6	729 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	TTC25	Q96NG3	672 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	TMEM237	Q96Q45	408 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	FIZ1	Q96SL8	496 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	GPR88	Q9GZN0	384 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	THAP2	Q9H0W7	228 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	DPH5	Q9H2P9	285 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	KLK15	Q9H2R5	256 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	RMI1	Q9H9A7	625 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	NOD2	Q9HC29	1040 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	FETUB	Q9UGM5	382 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	POLL	Q9UGP5	575 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341		A0A1B0GUL6	1792 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	ITGB4	P16144	1822 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	COL4A1	P02462	1669 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	LY75	O60449	1722 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	TLDC2	A0PJX2	215 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	ATP2A1	O14983	1001 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	CLIC2	O15247	247 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	PSTPIP1	O43586	416 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	SPOP	O43791	374 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	DCTN3	O75935	186 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	CCNB1	P14635	433 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	TSHR	P16473	764 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	ENPP1	P22413	925 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	SFN	P31947	248 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	ID4	P47928	161 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	GPC3	P51654	580 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	PROK1	P58294	105 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	GTF2B	Q00403	316 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	GCNT1	Q02742	428 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	OCA2	Q04671	838 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	PICALM	Q13492	652 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	E2F5	Q15329	346 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	CCNG2	Q16589	344 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	CBWD6	Q4V339	395 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	LRRC38	Q5VT99	294 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	AFMID	Q63HM1	303 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	KRT39	Q6A163	491 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	ASRGL1	Q7L266	308 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	SPATA21	Q7Z572	469 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	CEP57	Q86XR8	500 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	TPH2	Q8IWU9	490 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	OR7D4	Q8NG98	312 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	TCP11	Q8WWU5	503 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	C18orf8	Q96DM3	657 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	RAX2	Q96IS3	184 aa		4.36	□□□□□ -1.71

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