RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 BAG5Q9UL15 447 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CCPG1Q9ULG6 757 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 MTMR6Q9Y217 621 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 GMEB1Q9Y692 573 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SPACA6W5XKT8 324 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM205AQ6ZU69 1335 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 FRMD3A2A2Y4 597 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 OOEPA6NGQ2 149 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM47DPA6NHR8 397 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CAPN14A8MX76 684 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PATE3B3GLJ2 98 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 KCNJ18B7U540 433 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 STMND1H3BQB6 276 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 MYO1CO00159 1063 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CXCL11O14625 94 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 VEGFDO43915 354 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CIDEAO60543 219 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 TADA2AO75478 443 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PSMD10O75832 226 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 RECQL4O94761 1208 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 RHOBTB1O94844 696 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 AKR7A3O95154 331 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 MATN4O95460 622 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 DIRAS3O95661 229 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 KRT14P02533 472 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 WEE2P0C1S8 567 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 RALAP11233 206 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ETS1P14921 441 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 FAHP16930 419 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PRKACBP22694 351 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 DNAJB1P25685 340 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PSMA5P28066 241 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 GDF5P43026 501 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC15A1P46059 708 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SELENOPP49908 381 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CDK7P50613 346 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 RAB28P51157 221 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 AP3M2P53677 418 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PMS2P54278 862 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PRRX1P54821 245 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CDH15P55291 814 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 NRG3P56975 720 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SCGB2A2Q13296 93 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 KCNJ12Q14500 433 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC29A2Q14542 456 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 IRF3Q14653 427 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SKIDA1Q1XH10 827 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 TRIM60Q495X7 471 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CFAP157Q5JU67 520 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PHF19Q5T6S3 580 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ARHGAP17Q68EM7 881 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 NEK5Q6P3R8 708 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CRIP3Q6Q6R5 217 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 KIF6Q6ZMV9 814 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 KIAA0408Q6ZU52 694 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 DSG4Q86SJ6 1040 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 TLK2Q86UE8 772 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 COMTD1Q86VU5 262 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 LINC00346Q8IVM7 164 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CCDC28AQ8IWP9 274 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PALM2Q8IXS6 379 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CLYBLQ8N0X4 340 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC15A4Q8N697 577 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 FSIP1Q8NA03 581 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 MCUQ8NE86 351 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 LPCAT1Q8NF37 534 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 OR52M1Q8NGK5 317 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CFHR4Q92496 578 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CORO2AQ92828 525 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM149B1Q96BN6 582 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 LRRC39Q96DD0 335 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 IFT74Q96LB3 600 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 TCEANC2Q96MN5 208 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SORCS2Q96PQ0 1159 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 FIZ1Q96SL8 496 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CD180Q99467 661 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CCT7Q99832 543 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 BCL7BQ9BQE9 202 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 UQCC2Q9BRT2 126 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PIMREGQ9BSJ6 248 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 TPPP3Q9BW30 176 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 MEGF9Q9H1U4 602 aa3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms