RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550159.5

CS-218, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-218ENST00000550159 SPEM1Q8N4L4 309 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 PQLC3Q8N755 202 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 BBOF1Q8ND07 529 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 GANCQ8TET4 914 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 CHFRQ96EP1 664 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 IFT43Q96FT9 208 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 LRIG1Q96JA1 1093 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP9.78□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 ADGRE3Q9BY15 652 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 RAB17Q9H0T7 212 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP9.78□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 PAK5Q9P286 719 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 RSPH14Q9UHP6 348 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 SCML1Q9UN30 329 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 HS3ST2Q9Y278 367 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 GPSM3Q9Y4H4 160 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 I6L893 689 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 K7ESF4 209 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 ALOX15BO15296 676 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 LIASO43766 372 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 RNF40O75150 1001 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 TMCC1O94876 653 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 GSRP00390 522 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 JCHAINP01591 159 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 DNTTP04053 509 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 CEACAM1P13688 526 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 HOXB2P14652 356 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 EPHB1P54762 984 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 AP1S1P61966 158 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 BCL2L1Q07817 233 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 ZNF234Q14588 700 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 DLG2Q15700 870 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 COL28A1Q2UY09 1125 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 PLA2G2CQ5R387 149 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 AFMIDQ63HM1 303 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 TCEAL6Q6IPX3 200 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 POTEHQ6S545 545 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 CEP128Q6ZU80 1094 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 ADIPOR2Q86V24 386 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 PLPP6Q8IY26 295 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 APCDD1Q8J025 514 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 SH2D3CQ8N5H7 860 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 C1orf54Q8WWF1 131 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 TCEAL3Q969E4 200 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 LGMNQ99538 433 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 EDEM2Q9BV94 578 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 FSD1LQ9BXM9 530 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 AP1M1Q9BXS5 423 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 NT5MQ9NPB1 228 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 VPS45Q9NRW7 570 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 ETNK2Q9NVF9 386 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 ASIC3Q9UHC3 531 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 DNPEPQ9ULA0 475 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 MSRB2Q9Y3D2 182 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 STON1Q9Y6Q2 735 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 RNF103O00237 685 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 ATP9BO43861 1147 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 MAFKO60675 156 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 ADH1BP00325 375 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 EGFP01133 1207 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 CHRNB1P11230 501 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 FDFT1P37268 417 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 MPLP40238 635 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 SCNN1BP51168 640 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 IRAK1P51617 712 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 GEMP55040 296 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 DR1Q01658 176 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 ZBTB16Q05516 673 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 CALCOCO2Q13137 446 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 LAMB3Q13751 1172 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 TEX44Q53QW1 395 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 CARD16Q5EG05 197 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 DCAF12L1Q5VU92 463 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 C8orf74Q6P047 294 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 C22orf39Q6P5X5 142 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 NPNTQ6UXI9 565 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 LINGO4Q6UY18 593 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-218ENST00000550159 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms