RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549278.1

AC024909.1-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AC024909.1, Length 599 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC024909.1-201ENST00000549278 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 DPEP3Q9H4B8 488 aa5.05□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 PLAC1Q9HBJ0 212 aa5.05□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa5.05□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 ZBTB26Q9HCK0 441 aa5.05□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 PIGVQ9NUD9 493 aa5.05□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa5.05□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 FBXO5Q9UKT4 447 aa5.05□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 EMCNQ9ULC0 261 aa5.05□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 SLC39A10Q9ULF5 831 aa5.05□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 SCML2Q9UQR0 700 aa5.05□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 POMPQ9Y244 141 aa5.05□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 VWA7Q9Y334 891 aa5.05□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 TCAF1Q9Y4C2 921 aa5.05□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 ASB3Q9Y575 518 aa5.05□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 EVPLQ92817 2033 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 DPPA5A6NC42 116 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 ARL5CA6NH57 179 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 YJEFN3A6XGL0 299 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 TARM1B6A8C7 271 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 HHLA1C9JL84 531 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 H7C4K7 107 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 KCNK1O00180 336 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 PTGESO14684 152 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 GIPC1O14908 333 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 SPTLC1O15269 473 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 TREHO43280 583 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 HOXA2O43364 376 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 DCXO43602 365 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 ATP9BO43861 1147 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 B3GAT3O94766 335 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 OAZ2O95190 189 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 CRTAMO95727 393 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 MLYCDO95822 493 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 CHEK2O96017 543 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 ALDH1A1P00352 501 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 AHSGP02765 367 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 CAPNS1P04632 268 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 FGF1P05230 155 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 FYNP06241 537 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 PYGLP06737 847 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 LYNP07948 512 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 USP17L7P0C7H9 530 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 NFKB1P19838 968 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 OGNP20774 298 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 IMPDH1P20839 514 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 IL10P22301 178 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 SP100P23497 879 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 PIK3R1P27986 724 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 ADRA1AP35348 466 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 RPL5P46777 297 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 PPP3CCP48454 512 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 CHN2P52757 468 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 NAGLUP54802 743 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 INHBCP55103 352 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 SESN3P58005 492 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 PURAQ00577 322 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 IL10RBQ08334 325 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 SREBF2Q12772 1141 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 BNIP2Q12982 314 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 CUL3Q13618 768 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 FLOT2Q14254 428 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 GRM2Q14416 872 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 INPP5AQ14642 412 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 CNGA3Q16281 694 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 SMU1Q2TAY7 513 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 TMEM259Q4ZIN3 620 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 FAM26DQ5JW98 314 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 SYPL2Q5VXT5 272 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 AFMIDQ63HM1 303 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 OVOS1Q6IE37 1185 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 BORAQ6PGQ7 559 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 GLB1LQ6UWU2 654 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 NUDT18Q6ZVK8 323 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 CHSY3Q70JA7 882 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 SPATA19Q7Z5L4 167 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 ARPINQ7Z6K5 226 aa5.04□□□□□ -1.6
AC024909.1-201ENST00000549278 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 137.2 ms