RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 PTPN9P43378 593 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 SOX10P56693 466 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 SLC20A2Q08357 652 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 ACSM2AQ08AH3 577 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 ACSM2BQ68CK6 577 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 ARCQ7LC44 396 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 DHFR2Q86XF0 187 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 FBXO25Q8TCJ0 367 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 TRPC4APQ8TEL6 797 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 RNF157Q96PX1 679 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 SLC38A2Q96QD8 506 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF607Q96SK3 696 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 CDHR5Q9HBB8 845 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 C3orf14Q9HBI5 128 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 SERHLQ9NQF3 203 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 MAP10Q9P2G4 905 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 ATP6V1HQ9UI12 483 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 DUSP10Q9Y6W6 482 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 SALL3Q9BXA9 1300 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 NFAT5O94916 1531 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 PER2O15055 1255 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 CCNA2P20248 432 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 PSMB4P28070 264 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 LGALS3BPQ08380 585 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 INAVAQ3KP66 663 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 TCEAL5Q5H9L2 206 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 RAP1GAP2Q684P5 730 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 LRRC34Q8IZ02 419 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 ADAM32Q8TC27 787 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 BIRC5O15392 142 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 BGNP21810 368 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 GLUD2P49448 558 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 COX10Q12887 443 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 NDUFA9Q16795 377 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 ZCWPW2Q504Y3 356 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 PDZK1Q5T2W1 519 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 TRIM40Q6P9F5 258 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 CHSY3Q70JA7 882 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 FAM220AQ7Z4H9 259 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 TTC7BQ86TV6 843 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC103Q8IW40 242 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 ALLCQ8N6M5 410 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 MDM1Q8TC05 714 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF398Q8TD17 642 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 PLD4Q96BZ4 506 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 FERD3LQ96RJ6 166 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 HAO1Q9UJM8 370 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 SATB2Q9UPW6 733 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 PNLIPRP1P54315 467 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 RHBDL3P58872 404 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 RAB10P61026 200 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 LAPTM5Q13571 262 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 ATAT1Q5SQI0 421 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 DOK6Q6PKX4 331 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 ITFG1Q8TB96 612 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 TCP10LQ8TDR4 215 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 STYXQ8WUJ0 223 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 CATSPER2Q96P56 530 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 BTBD10Q9BSF8 475 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 BRD9Q9H8M2 597 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 INPP4BO15327 924 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 TLR5O60602 858 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 CYP7B1O75881 506 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 FGBP02675 491 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 ETS1P14921 441 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 FEN1P39748 380 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 SCTRP47872 440 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 LIPMQ5VYY2 423 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 PROSER1Q86XN7 944 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 GJD3Q8N144 294 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 KLRG1Q96E93 195 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 CDT1Q9H211 546 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 KCND1Q9NSA2 647 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 VAV3Q9UKW4 847 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 CNTNAP1P78357 1384 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 ATG13O75143 517 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 ALPPL2P10696 532 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 LBPP18428 481 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 ICAM3P32942 547 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 RPL21P46778 160 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
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