RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533099.5

RNPC3-208, Transcript of RNA binding region (RNP1, RRM) containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene RNPC3, Length 3,641 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3-208ENST00000533099 ICAM3P32942 547 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 GGT5P36269 586 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 RGS2P41220 211 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 RAB10P61026 200 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 ECT2LQ008S8 904 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 MAPK11Q15759 364 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 ZNF534Q76KX8 674 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 ERO1BQ86YB8 467 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 CBR4Q8N4T8 237 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 TMIGD2Q96BF3 282 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 RTKNQ9BST9 563 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 SPON1Q9HCB6 807 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 RGS18Q9NS28 235 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 STK39Q9UEW8 545 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 LRRC14BA6NHZ5 514 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 H3BMM5 538 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 KLF11O14901 512 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 AP2A1O95782 977 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 ATP6V1B2P21281 511 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 TRAF2Q12933 501 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 GALNT3Q14435 633 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 FRA10AC1Q70Z53 315 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 CUZD1Q86UP6 607 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 FAM35AQ86V20 835 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 VPS33AQ96AX1 596 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 SORT1Q99523 831 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 COLEC11Q9BWP8 271 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 IL22Q9GZX6 179 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 MROH8Q9H579 483 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 NDFIP2Q9NV92 336 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 RBPJLQ9UBG7 517 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 MYRFQ9Y2G1 1151 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 IRF1P10914 325 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 CRABP2P29373 138 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 SLC1A2P43004 574 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 SLC26A2P50443 739 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 TSPY1Q01534 308 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 INPP5AQ14642 412 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 MAPRE2Q15555 327 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 GNASQ5JWF2 1037 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 TMEM110Q86TL2 294 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 OSTM1Q86WC4 334 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 NPWQ8N729 165 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 CANT1Q8WVQ1 401 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 CD274Q9NZQ7 290 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 FZD10Q9ULW2 581 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 SORCS3Q9UPU3 1222 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 U3KQV3 271 aa8.3□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 HACD1B0YJ81 288 aa8.29□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 ABLIM1O14639 778 aa8.29□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 SNNO75324 88 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 CHEK2O96017 543 aa8.29□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 HGFP14210 728 aa8.29□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 FMO4P31512 558 aa8.29□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 LILRA4P59901 499 aa8.29□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 TWF1Q12792 350 aa8.29□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 BFSP2Q13515 415 aa8.29□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 TIGD2Q4W5G0 525 aa8.29□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa8.29□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 STK32CQ86UX6 486 aa8.29□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.082e-6■■□□□ 13.9
RNPC3-208ENST00000533099 PCED1BQ96HM7 432 aa8.29□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 KCNA7Q96RP8 456 aa8.29□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 BPIFA1Q9NP55 256 aa8.29□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 DNAJC28Q9NX36 388 aa8.29□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 RRN3Q9NYV6 651 aa8.29□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 MOCS1Q9NZB8 636 aa8.29□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 KCTD3Q9Y597 815 aa8.29□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.088e-6■■■■■ 107
RNPC3-208ENST00000533099 SYCE1LA8MT33 242 aa8.29□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 TRIM38O00635 465 aa8.29□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 NDUFS3O75489 264 aa8.29□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 ANXA9O76027 345 aa8.29□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 TMCC1O94876 653 aa8.29□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 THP07101 528 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms