RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533062.5

CHORDC1-208, Transcript of cysteine and histidine rich domain containing 1, human

TSL 4

Gene CHORDC1, Length 575 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHORDC1-208	ENST00000533062	CALN1	Q9BXU9	219 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	SP110	Q9HB58	689 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	PREB	Q9HCU5	417 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	DONSON	Q9NYP3	566 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	CACNA1E	Q15878	2313 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	KNL1	Q8NG31	2342 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062		A0A1W2PR77	199 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	MUSK	O15146	869 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	VILL	O15195	856 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	SPINT1	O43278	529 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	MAP3K6	O95382	1288 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	CER1	O95813	267 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	TNNT1	P13805	278 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	ARSE	P51690	589 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	CLDN2	P57739	230 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	SEMG2	Q02383	582 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	IL10RB	Q08334	325 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	ZNF284	Q2VY69	593 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	TTC7B	Q86TV6	843 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	HORMAD1	Q86X24	394 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	LZTR1	Q8N653	840 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	IGLON5	A6NGN9	336 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	TLR4	O00206	839 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	NEMP1	O14524	444 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	PRKCG	P05129	697 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	CEACAM1	P13688	526 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	TIMP2	P16035	220 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	MAGEA1	P43355	309 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	FOXK2	Q01167	660 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	RAD51	Q06609	339 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	FGL2	Q14314	439 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	STAT4	Q14765	748 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	NAXD	Q8IW45	347 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	FAM71B	Q8TC56	605 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	RAPGEF5	Q92565	580 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	SLC32A1	Q9H598	525 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	RAD51B	O15315	384 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	MFSD11	O43934	449 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	MAFK	O60675	156 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	MMP20	O60882	483 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	PEX11B	O96011	259 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	ADRB1	P08588	477 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	KRT7	P08729	469 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	KDELR1	P24390	212 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	MAN1A1	P33908	653 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	SCNN1B	P51168	640 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	SLC14A1	Q13336	389 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	NEK5	Q6P3R8	708 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	SRL	Q86TD4	932 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	RFFL	Q8WZ73	363 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	SKA1	Q96BD8	255 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	FEM1C	Q96JP0	617 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHORDC1-208	ENST00000533062	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55

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