RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 MYLK3Q32MK0 819 aa24.39■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 ARCQ7LC44 396 aa24.39■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 VPS36Q86VN1 386 aa24.39■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 PYROXD2Q8N2H3 581 aa24.39■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 OR2AP1Q8NGE2 309 aa24.39■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM248Q9NWD8 314 aa24.39■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 C2CD4BA6NLJ0 364 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 EPHB6O15197 1021 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 MMP20O60882 483 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 GP1BAP07359 652 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 MMP8P22894 467 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 MAPKAPK2P49137 400 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 PFN3P60673 137 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 CDR2Q01850 454 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 C3orf38Q5JPI3 329 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 TTC7BQ86TV6 843 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF248Q8NDW4 579 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM172AQ8WUF8 416 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 TBC1D31Q96DN5 1066 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 PCDHB18PQ96TA0 734 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 KLC2Q9H0B6 622 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 MAGEH1Q9H213 219 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 CPNE5Q9HCH3 593 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 DACH1Q9UI36 760 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 HPCAL4Q9UM19 191 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 MGAQ8IWI9 3026 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 MUSKO15146 869 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 BUB1O43683 1085 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 RAMP2O60895 175 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 GCATO75600 419 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 GSRP00390 522 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 IGFALSP35858 605 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 ETFBP38117 255 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 HDAC4P56524 1084 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 TCEA2Q15560 299 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 ISXQ2M1V0 245 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 PERM1Q5SV97 790 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 IL12RB2Q99665 862 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 NUP62CLQ9H1M0 184 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 EVA1BQ9NVM1 165 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 SATB2Q9UPW6 733 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 LRRK1Q38SD2 2015 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 PMS2P1A4D2B8 440 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 KDELR3O43731 214 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 POP4O95707 220 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 LSSP48449 732 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 ADKP55263 362 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 PRRT3Q5FWE3 981 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 FOXR1Q6PIV2 292 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 PCSK4Q6UW60 755 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 GDPD4Q6W3E5 623 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF677Q86XU0 584 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 PLPP6Q8IY26 295 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 RAB7BQ96AH8 199 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 CENPTQ96BT3 561 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 HIC2Q96JB3 615 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP24.36■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 USP29Q9HBJ7 922 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 INSIG1O15503 277 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 TMCC1O94876 653 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 SOX5P35711 763 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 PTPN9P43378 593 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 THOP1P52888 689 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 PTP4A2Q12974 167 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 ARHGAP40Q5TG30 622 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 STRADAQ7RTN6 431 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 PHACTR4Q8IZ21 702 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 VCPIP1Q96JH7 1222 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 ASCL3Q9NQ33 180 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 COQ6Q9Y2Z9 468 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 KALRNO60229 2985 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa24.34■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 AREL1O15033 823 aa24.34■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 KRT3P12035 628 aa24.34■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 JAM2P57087 298 aa24.34■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.6 ms