RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524705.2

BBS1-205, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 3

Gene BBS1, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-205	ENST00000524705	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	MGARP	Q8TDB4	240 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	MZB1	Q8WU39	189 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	CDKL2	Q92772	493 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	ATP2A3	Q93084	1043 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	TTC17	Q96AE7	1141 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	TIFA	Q96CG3	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	IFT43	Q96FT9	208 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	CERS2	Q96G23	380 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	LMLN	Q96KR4	655 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	PSKH2	Q96QS6	385 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	MGME1	Q9BQP7	344 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	KIFC1	Q9BW19	673 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	BBS2	Q9BXC9	721 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	NOD2	Q9HC29	1040 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	LHX3	Q9UBR4	397 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	VPS51	Q9UID3	782 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	CHKB	Q9Y259	395 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	KCTD3	Q9Y597	815 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	HMX2	A2RU54	273 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	GOLGA8R	I6L899	631 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	TRIM24	O15164	1050 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	KRT37	O76014	449 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	PAPLN	O95428	1278 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	GLP2R	O95838	553 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	PRL	P01236	227 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	EPO	P01588	193 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	MT-ND3	P03897	115 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	PDHA1	P08559	390 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	PIRT	P0C851	137 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	TYR	P14679	529 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	TCF3	P15923	654 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	KRT4	P19013	534 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	HLA-DPA1	P20036	260 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	CES1	P23141	567 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	WEE1	P30291	646 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	BMP8B	P34820	402 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	ABCG1	P45844	678 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	PLK1	P53350	603 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	RHOA	P61586	193 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	TRAF2	Q12933	501 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	PTPRCAP	Q14761	206 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	LRRC14	Q15048	493 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	DHCR24	Q15392	516 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	SLC14A2	Q15849	920 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	CNGA3	Q16281	694 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	FUT11	Q495W5	492 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	LGSN	Q5TDP6	509 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	MROH9	Q5TGP6	573 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	RNF43	Q68DV7	783 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	PACS1	Q6VY07	963 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	SRL	Q86TD4	932 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	KCNMB4	Q86W47	210 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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