RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524356.1

PCM1-223, Transcript of pericentriolar material 1, human

TSL 2

Gene PCM1, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCM1-223	ENST00000524356	FYB1	O15117	783 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	TBX10	O75333	385 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	RASSF9	O75901	435 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	DNAJB5	O75953	348 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	JTB	O76095	146 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	UNC5C	O95185	931 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	RHO	P08100	348 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	CYP21A2	P08686	494 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	QDPR	P09417	244 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	NR2F6	P10588	404 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	P4HA1	P13674	534 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	DDC	P20711	480 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	PCSK6	P29122	969 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	RFC4	P35249	363 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	PGM1	P36871	562 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	NXPH1	P58417	271 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	TFCP2	Q12800	502 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	TDG	Q13569	410 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	DYRK1A	Q13627	763 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	ADIPOQ	Q15848	244 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	TRIM60	Q495X7	471 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	GALNTL6	Q49A17	601 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	ANO7	Q6IWH7	933 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	CEP85	Q6P2H3	762 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	MTFR2	Q6P444	385 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	RAPH1	Q70E73	1250 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	GALNT7	Q86SF2	657 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	CNGA4	Q8IV77	575 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	YAF2	Q8IY57	180 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	TAGAP	Q8N103	731 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	GALNT16	Q8N428	558 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	SLC15A4	Q8N697	577 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	USP38	Q8NB14	1042 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	SPSB4	Q96A44	273 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	PERP	Q96FX8	193 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	TSGA13	Q96PP4	275 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	HGH1	Q9BTY7	390 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	C4B	P0C0L5	1744 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF213	O14771	459 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	TSPAN3	O60637	253 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	GPR32	O75388	356 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	SLC22A3	O75751	556 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	NTSR2	O95665	410 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	ANXA6	P08133	673 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	SBK3	P0C264	359 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	CPA1	P15085	419 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	IFNAR1	P17181	557 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	DES	P17661	470 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	CIITA	P33076	1130 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	THPO	P40225	353 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	PSMB10	P40306	273 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	PAFAH1B1	P43034	410 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF132	P52740	706 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	UCP3	P55916	312 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	UBASH3A	P57075	661 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	UBXN2A	P68543	259 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	MC2R	Q01718	297 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	ITIH3	Q06033	890 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	PDCL	Q13371	301 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	GRM4	Q14833	912 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	E2F5	Q15329	346 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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