RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519846.5

CLVS1-205, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLVS1, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-205ENST00000519846 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 OR2I1PQ8NGU4 316 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 OR6P1Q8NGX9 317 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 RUBCNQ92622 972 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 MRGPRX1Q96LB2 322 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 PEBP4Q96S96 227 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 CDH19Q9H159 772 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 NT5MQ9NPB1 228 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 MARK1Q9P0L2 795 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 MUC3AQ02505 3323 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 PROSCO94903 275 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 LATS1O95835 1130 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 IGLV3-27P01718 113 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 TMEM253P0C7T8 217 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 ITPKAP23677 461 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 IL1R2P27930 398 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 GSDMDP57764 484 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 E2F5Q15329 346 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 TRIM61Q5EBN2 209 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 LYSMD4Q5XG99 296 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 RFX8Q6ZV50 586 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 RD3Q7Z3Z2 195 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 ADIPOR2Q86V24 386 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 TP53INP2Q8IXH6 220 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 RHOT2Q8IXI1 618 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 OR2T3Q8NH03 318 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 HAPLN3Q96S86 360 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 ISCUQ9H1K1 167 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 PRSS16Q9NQE7 514 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 ETNK2Q9NVF9 386 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 UVRAGQ9P2Y5 699 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 FBXO4Q9UKT5 387 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 FZD10Q9ULW2 581 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 SHISA7A6NL88 538 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 J3KR12 359 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 KCNK1O00180 336 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 RHOBTB1O94844 696 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 KRT7P08729 469 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 ACSL1P33121 698 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 FZD5Q13467 585 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 CST6Q15828 149 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 SYCP2LQ5T4T6 812 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 PDLIM2Q96JY6 352 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 SUV39H2Q9H5I1 410 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 FZD3Q9NPG1 666 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 DONSONQ9NYP3 566 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 KCNMB2Q9Y691 235 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 FAM221AA4D161 298 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 TMCC1O94876 653 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 SEMA4FO95754 770 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 BPNT1O95861 308 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 IGSF6O95976 241 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 JCHAINP01591 159 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 L1CAMP32004 1257 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 CHRNA3P32297 505 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 SERPINB6P35237 376 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 METAP1P53582 386 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 PCSK7Q16549 785 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 FAM46CQ5VWP2 391 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 C22orf39Q6P5X5 142 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 NPNTQ6UXI9 565 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 BEND5Q7L4P6 421 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 TXLNBQ8N3L3 684 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 CAMKK1Q8N5S9 505 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 KLHL32Q96NJ5 620 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 SLC39A8Q9C0K1 460 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 PCDH18Q9HCL0 1135 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 TCF7L1Q9HCS4 588 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 CA5BQ9Y2D0 317 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 ALG6Q9Y672 507 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 WDFY4Q6ZS81 3184 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 ILVBLA1L0T0 632 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 LRRC72A6NJI9 287 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 K7ESF4 209 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms