RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RHOAP61586 193 aa17.07■□□□□ 0.32
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 SGCGQ13326 291 aa17.07■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa17.07■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VPS36Q86VN1 386 aa17.07■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GALNT15Q8N3T1 639 aa17.07■□□□□ 0.32
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 FGL2Q14314 439 aa17.06■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GRM3Q14832 879 aa17.06■□□□□ 0.32
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 BMFQ96LC9 184 aa17.06■□□□□ 0.32
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 PDFQ9HBH1 243 aa17.06■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa17.06■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYO1AQ9UBC5 1043 aa17.06■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 NEMP1O14524 444 aa17.05■□□□□ 0.32
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR13H1Q8NG92 308 aa17.05■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TSC1Q92574 1164 aa17.05■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYOCQ99972 504 aa17.05■□□□□ 0.32
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC39A8Q9C0K1 460 aa17.05■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FZD3Q9NPG1 666 aa17.05■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GPR27Q9NS67 375 aa17.05■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGLON5A6NGN9 336 aa17.04■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 J3KR12 359 aa17.04■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FPGTO14772 594 aa17.04■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CAPNS1P04632 268 aa17.04■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CSNK1DP48730 415 aa17.04■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CLDN2P57739 230 aa17.04■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMPRSS12Q86WS5 348 aa17.04■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC25A45Q8N413 288 aa17.04■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LZTR1Q8N653 840 aa17.04■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DENND6BQ8NEG7 585 aa17.04■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CPLX3Q8WVH0 158 aa17.04■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CALN1Q9BXU9 219 aa17.04■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZWILCHQ9H900 591 aa17.04■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LHX3Q9UBR4 397 aa17.04■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ASPMQ8IZT6 3477 aa17.04■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KNTC1P50748 2209 aa17.04■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PTPRBP23467 1997 aa17.03■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POM121BA6NF01 834 aa17.03■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPINT1O43278 529 aa17.03■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TIMP2P16035 220 aa17.03■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CKMT2P17540 419 aa17.03■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DGKAP23743 735 aa17.03■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RABIFP47224 123 aa17.03■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP17.03■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ILKQ13418 452 aa17.03■□□□□ 0.32
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