RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498520.1

NDUFS1-210, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S1, humanhuman

TSL 2

Gene NDUFS1, Length 593 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1-210ENST00000498520 ERVFRD-1P60508 538 aa6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 MYL6P60660 151 aa6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 ROR1Q01973 937 aa6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 LPAL2Q16609 132 aa6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 TUBB8Q3ZCM7 444 aa6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 SPDYCQ5MJ68 293 aa6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 CFAP58Q5T655 872 aa6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 DCAF12L1Q5VU92 463 aa6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 LRIG3Q6UXM1 1119 aa6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 TPRG1Q6ZUI0 275 aa6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 MON1BQ7L1V2 547 aa6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 Q8N1Y9 231 aa6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 TTC39CQ8N584 583 aa6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 TMEM35BQ8NCS4 154 aa6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 ZNF606Q8WXB4 792 aa6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 CPA5Q8WXQ8 436 aa6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 ALG3Q92685 438 aa6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 RUFY1Q96T51 708 aa6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 KCNJ15Q99712 375 aa6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 ERP44Q9BS26 406 aa6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 OSBPL6Q9BZF3 934 aa6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 FAM129AQ9BZQ8 928 aa6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 SLC6A17Q9H1V8 727 aa6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 CDT1Q9H211 546 aa6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 IPPKQ9H8X2 491 aa6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 CYP3A43Q9HB55 503 aa6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 HOMER3Q9NSC5 361 aa6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 PARVAQ9NVD7 372 aa6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 ADAM22Q9P0K1 906 aa6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 PCYOX1Q9UHG3 505 aa6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 DPP7Q9UHL4 492 aa6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 FBXO4Q9UKT5 387 aa6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa6.8□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 LACTBL1A8MY62 500 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 AGPSO00116 658 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 LAMTOR5O43504 91 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 ECI2O75521 394 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 PROSCO94903 275 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 PAEPP09466 180 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 PYGMP11217 842 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 P4HA1P13674 534 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 PTPN2P17706 415 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 RRM1P23921 792 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 GRK2P25098 689 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 MAN1A1P33908 653 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 GRK3P35626 688 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 CDR1P51861 262 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 OSTNP61366 133 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 NOMO3P69849 1222 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 DR1Q01658 176 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 CYP1B1Q16678 543 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 ZNF699Q32M78 642 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 ZNF667Q5HYK9 610 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 NAA35Q5VZE5 725 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 DUPD1Q68J44 220 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 SLC8B1Q6J4K2 584 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 VITQ6UXI7 678 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 RHOT1Q8IXI2 618 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 IQCKQ8N0W5 287 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 ZNF461Q8TAF7 563 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 KRT35Q92764 455 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 SH3GL2Q99962 352 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 ADPGKQ9BRR6 497 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 MTMR12Q9C0I1 747 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 XYLT2Q9H1B5 865 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 LHX5Q9H2C1 402 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 LRRC19Q9H756 370 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 CISHQ9NSE2 258 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 VPS18Q9P253 973 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 IP6K2Q9UHH9 426 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 AMACRQ9UHK6 382 aa6.79□□□□□ -1.32
NDUFS1-210ENST00000498520 ANAPC7Q9UJX3 599 aa6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.7 ms