RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 RPS16P62249 146 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 MGAT5Q09328 741 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 NIPAL4Q0D2K0 466 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 LCP2Q13094 533 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 CALCOCO2Q13137 446 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 XRCC4Q13426 336 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 KARSQ15046 597 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 DECR1Q16698 335 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 IGSF11Q5DX21 431 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 CT83Q5H943 113 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 C3orf38Q5JPI3 329 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 PLA2G4FQ68DD2 849 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 RAET1GQ6H3X3 334 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM53Q6P2H8 277 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 CHST9Q7L1S5 443 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 KCTD9Q7L273 389 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 HAUS6Q7Z4H7 955 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 SPATA19Q7Z5L4 167 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 AKAP14Q86UN6 197 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 KBTBD6Q86V97 674 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 OSTM1Q86WC4 334 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 PPIL6Q8IXY8 311 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 CLYBLQ8N0X4 340 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 STEAP2Q8NFT2 490 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 LZICQ8WZA0 190 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 NT5C3BQ969T7 300 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 C3orf49Q96BT1 292 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 ALS2CR12Q96Q35 445 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 EDEM2Q9BV94 578 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 BTBD2Q9BX70 525 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 USP26Q9BXU7 913 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
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PDCD4-211ENST00000498367 BARHL2Q9NY43 387 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 GULP1Q9UBP9 304 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 CPA4Q9UI42 421 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 CYTH4Q9UIA0 394 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 NAGPAQ9UK23 515 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 USP21Q9UK80 565 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 FBXW2Q9UKT8 454 aa7.38□□□□□ -1.23
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PDCD4-211ENST00000498367 CA14Q9ULX7 337 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 KCNK7Q9Y2U2 307 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa7.38□□□□□ -1.23
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PDCD4-211ENST00000498367 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 A0A0U1RQS6 177 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 GSAPA4D1B5 854 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 HTR3EA5X5Y0 456 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 PSMD11O00231 422 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 PLK4O00444 970 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 SOCS6O14544 535 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 CHMP2AO43633 222 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 TULP3O75386 442 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 SURF6O75683 361 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 SEC14L2O76054 403 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 C22orf31O95567 290 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 ONECUT2O95948 504 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 CH25HO95992 272 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 GLAP06280 429 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 CPA1P15085 419 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 CKMT2P17540 419 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 SREBF1P36956 1147 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 CCT3P49368 545 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 S100A12P80511 92 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 IRF9Q00978 393 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 PPP3CAQ08209 521 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 LGALS3BPQ08380 585 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 IRF3Q14653 427 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 MED22Q15528 200 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 SMTNL2Q2TAL5 461 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 TTMPQ5BVD1 217 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 ADGRF1Q5T601 910 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 ARMC12Q5T9G4 340 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
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