RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498219.5

HPS1-214, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 845 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-214ENST00000498219 DYRK4Q9NR20 520 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 SUSD2Q9UGT4 822 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 DNAH14Q0VDD8 3507 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 A0A1B0GVT2 93 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 ARHGAP33O14559 1287 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 PSTPIP1O43586 416 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 GSRP00390 522 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 UGT2B4P06133 528 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 KCNA4P22459 653 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 CD27P26842 260 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 MYLK3Q32MK0 819 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 TMCO3Q6UWJ1 677 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 MFSD7Q6UXD7 560 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 RABEPKQ7Z6M1 372 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 NT5DC3Q86UY8 548 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 MAP7D3Q8IWC1 876 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 PQLC3Q8N755 202 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 FAM131CQ96AQ9 280 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 SLC6A18Q96N87 628 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 RTKNQ9BST9 563 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 SP110Q9HB58 689 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 TM9SF3Q9HD45 589 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 DCHS1Q96JQ0 3298 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 C10orf142B7Z368 130 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 SLC7A4O43246 635 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 KRT86O43790 486 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 GJB3O75712 270 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 MAP3K6O95382 1288 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 IGSF6O95976 241 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 RGRP47804 291 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 LIMK1P53667 647 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 CCDC173Q0VFZ6 552 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 GRIK2Q13002 908 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 LRRC73Q5JTD7 316 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 MINDY1Q8N5J2 469 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 LRRN4Q8WUT4 740 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 FAF2Q96CS3 445 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 KLHL32Q96NJ5 620 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 RNF157Q96PX1 679 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 ZNF670Q9BS34 389 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 TSGA10Q9BZW7 698 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 DONSONQ9NYP3 566 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 LRRK1Q38SD2 2015 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 A0A1W2PPC4 97 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 C16orf96A6NNT2 1141 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 KCNK3O14649 394 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 MFSD11O43934 449 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 PIGNO95427 931 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 POP4O95707 220 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 WNT1P04628 370 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 KRT10P13645 584 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 SDHBP21912 280 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 ITGB7P26010 798 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 ABL2P42684 1182 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 CCR5P51681 352 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 ODF2Q5BJF6 829 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 PEX26Q7Z412 305 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 RFX6Q8HWS3 928 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 PLPP6Q8IY26 295 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 KATNAL2Q8IYT4 538 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 PPP1R16AQ96I34 528 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 MYOCQ99972 504 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 HDAC8Q9BY41 377 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 IL21RQ9HBE5 538 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 GGT7Q9UJ14 662 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 AMFRQ9UKV5 643 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 ITM2BQ9Y287 266 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 CA5BQ9Y2D0 317 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 CACNA1AO00555 2505 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 A0A1W2PQU0 124 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 MUSKO15146 869 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 PCDH8O95206 1070 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 SYPP08247 313 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 ADRB3P13945 408 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 PRLRP16471 622 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 ITIH2P19823 946 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms