RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246		H3BM21	787 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	PLK4	O00444	970 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	SH3BP5	O60239	455 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	PRAMEF11	O60813	436 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	PROSC	O94903	275 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	RARA	P10276	462 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	MX2	P20592	715 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	CTSK	P43235	329 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP2CB	P62714	309 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP2CA	P67775	309 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	BCL2L1	Q07817	233 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	FOXC1	Q12948	553 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	PTK2B	Q14289	1009 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	NUMA1	Q14980	2115 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	ARRDC3	Q96B67	414 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRC19	Q9H756	370 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	DKK3	Q9UBP4	350 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	INTU	Q9ULD6	942 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246		A6NNZ2	444 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	PCDHGA12	O60330	932 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	TM7SF2	O76062	418 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	THEGL	P0DJG4	465 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	ALPPL2	P10696	532 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	CDK4	P11802	303 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	CA4	P22748	312 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	MAN1A1	P33908	653 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC1A1	P43005	524 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	RABIF	P47224	123 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	CSNK1D	P48730	415 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	AP1S1	P61966	158 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	MESD	Q14696	234 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	CA9	Q16790	459 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	ATL2	Q8NHH9	583 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	BTBD6	Q96KE9	485 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	PEBP4	Q96S96	227 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIM7	Q9C029	511 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	NEU3	Q9UQ49	428 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	CACNA1E	Q15878	2313 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1B0GTQ1	180 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	NEMP2	A6NFY4	417 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246		H0Y8X5	98 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	TOR1B	O14657	336 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	SPOP	O43791	374 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	CD59	P13987	128 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	PRLR	P16471	622 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	AMPD1	P23109	780 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	CES1	P23141	567 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	MAGEA1	P43355	309 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	SCNN1B	P51168	640 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	THOP1	P52888	689 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	METAP1	P53582	386 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	NXPH1	P58417	271 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	ITK	Q08881	620 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	DPYS	Q14117	519 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	MARC1	Q5VT66	337 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	PIP4P1	Q86T03	277 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	SRL	Q86TD4	932 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		11.47	□□□□□ -0.57

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