RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP15.71■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BFARQ9NZS9 450 aa15.71■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCDHB8Q9UN66 801 aa15.71■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF510Q9Y2H8 683 aa15.71■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A096LPK6 155 aa15.71■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HACD1B0YJ81 288 aa15.71■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARVCFO00192 962 aa15.71■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BIRC5O15392 142 aa15.71■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SUPT3HO75486 399 aa15.71■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC4A1P02730 911 aa15.71■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SERPINE1P05121 402 aa15.71■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GP5P40197 560 aa15.71■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IDH3AP50213 366 aa15.71■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTPRCAPQ14761 206 aa15.71■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDPK2PQ6A1A2 396 aa15.71■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IZUMO2Q6UXV1 221 aa15.71■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DENND6AQ8IWF6 608 aa15.71■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DTNBP1Q96EV8 351 aa15.71■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABCC13Q9NSE7 274 aa15.71■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MARCH5Q9NX47 278 aa15.71■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DCDC2Q9UHG0 476 aa15.71■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FIS1Q9Y3D6 152 aa15.71■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYLKQ15746 1914 aa15.71■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TM7SF2O76062 418 aa15.7■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VNN2O95498 520 aa15.7■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CA8P35219 290 aa15.7■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SERPINB5P36952 375 aa15.7■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP15.7■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SCYL1Q96KG9 808 aa15.7■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SORT1Q99523 831 aa15.7■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC12A8A0AV02 714 aa15.7■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AURKAO14965 403 aa15.7■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHRNGP07510 517 aa15.7■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IRF1P10914 325 aa15.7■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SKIP12755 728 aa15.7■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANPEPP15144 967 aa15.7■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GALNT2Q10471 571 aa15.7■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SCAPQ12770 1279 aa15.7■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IHHQ14623 411 aa15.7■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NUP93Q8N1F7 819 aa15.7■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SGF29Q96ES7 293 aa15.7■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MARK4Q96L34 752 aa15.7■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSPAN18Q96SJ8 248 aa15.7■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYP2S1Q96SQ9 504 aa15.7■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NT5MQ9NPB1 228 aa15.7■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHD9Q3L8U1 2897 aa15.7■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TK2O00142 265 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ALDH1A2O94788 518 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SELPP16109 830 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PAX3P23760 479 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STEAP4Q687X5 459 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DEFB107AQ8IZN7 70 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MIPOL1Q8TD10 442 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EXOC2Q96KP1 924 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TEKT5Q96M29 485 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NDE1Q9NXR1 346 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SOX13Q9UN79 622 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLA2G4CQ9UP65 541 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AP2A1O95782 977 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 F9P00740 461 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACADSP16219 412 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SERPINB6P35237 376 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COPAP53621 1224 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MPP1Q00013 466 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC10A7Q0GE19 358 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CNPY1Q3B7I2 92 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HPS6Q86YV9 775 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PSMG2Q969U7 264 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HMCESQ96FZ2 354 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CASD1Q96PB1 797 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF208Q9H0X6 261 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TASP1Q9H6P5 420 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DSEQ9UL01 958 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MX2P20592 715 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CNTFP26441 200 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TBX4P57082 545 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM26DQ5JW98 314 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NXNQ6DKJ4 435 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FUT10Q6P4F1 479 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LCA5Q86VQ0 697 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCNMB4Q86W47 210 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF148Q8N7C7 305 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAPK15Q8TD08 544 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC9A7Q96T83 725 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GBA3Q9H227 469 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC40Q9H9A6 602 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COG4Q9H9E3 785 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GKN1Q9NS71 199 aa15.69■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAFKO60675 156 aa15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms