RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486621.1

TTC4-204, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 4, human

TSL 2

Gene TTC4, Length 549 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC4-204	ENST00000486621	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	NEMP2	A6NFY4	417 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	CCDC169	A6NNP5	214 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	PIR	O00625	290 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	PLD2	O14939	933 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	SDC3	O75056	442 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	FAM155B	O75949	473 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	IGHV4-34	P06331	123 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	THBD	P07204	575 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	CXCL8	P10145	99 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	CYP11B2	P19099	503 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	PROZ	P22891	400 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	DGKA	P23743	735 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	GUCY2F	P51841	1108 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	DGCR2	P98153	550 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	ARID5A	Q03989	594 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	PDIA5	Q14554	519 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	ZNF234	Q14588	700 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	SPATA1	Q5VX52	437 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	MBLAC2	Q68D91	279 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	VASH2	Q86V25	355 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	IFI44	Q8TCB0	444 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	GANC	Q8TET4	914 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	ARRDC3	Q96B67	414 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	SERAC1	Q96JX3	654 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	SPATA17	Q96L03	361 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	APOLD1	Q96LR9	279 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	ACBD6	Q9BR61	282 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	IL25	Q9H293	177 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	EBF2	Q9HAK2	575 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	RTTN	Q86VV8	2226 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	PLXNA2	O75051	1894 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	MTOR	P42345	2549 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	SCN1A	P35498	2009 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	TCHH	Q07283	1943 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	PTPRJ	Q12913	1337 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	CPED1	A4D0V7	1026 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	LRRC72	A6NJI9	287 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	EFCAB7	A8K855	629 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	LACTBL1	A8MY62	500 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	C22orf46	C9J442	243 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	PPEF2	O14830	753 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	WNT9A	O14904	365 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	CLDN3	O15551	220 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	FFAR2	O15552	330 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	TIMM44	O43615	452 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	LDLR	P01130	860 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	CLTA	P09496	248 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	RARG	P13631	454 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	LMO1	P25800	156 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	ANXA13	P27216	316 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	UGT1A5	P35504	534 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	MAGEA11	P43364	429 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	TAF6	P49848	677 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	GALC	P54803	685 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	OVGP1	Q12889	678 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	USP30	Q70CQ3	517 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	IQCH	Q86VS3	1027 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC4-204	ENST00000486621	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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