RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484528.1

USP40-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 933 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-215ENST00000484528 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa21.88■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 FASNP49327 2511 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 BAHCC1Q9P281 2608 aa21.87■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa21.87■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 LRRC10BA6NIK2 292 aa21.87■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 RASA4BC9J798 803 aa21.87■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 TEX33O43247 280 aa21.87■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 RASA4O43374 803 aa21.87■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 TSPAN6O43657 245 aa21.87■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 POP4O95707 220 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 FERP16591 822 aa21.87■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 RHOAP61586 193 aa21.87■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 SEMG2Q02383 582 aa21.87■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 TYRO3Q06418 890 aa21.87■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa21.87■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 DCUN1D2Q6PH85 259 aa21.87■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 MCOLN2Q8IZK6 566 aa21.87■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 RAB7BQ96AH8 199 aa21.87■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 LRIG1Q96JA1 1093 aa21.87■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 EXOC2Q96KP1 924 aa21.87■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa21.87■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 EPAS1Q99814 870 aa21.87■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 CNPY3Q9BT09 278 aa21.87■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa21.87■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 GPR27Q9NS67 375 aa21.87■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 FZD10Q9ULW2 581 aa21.87■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 AK5Q9Y6K8 562 aa21.87■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 TMCO5BA8MYB1 307 aa21.86■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 FPGTO14772 594 aa21.86■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 ITIH2P19823 946 aa21.86■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 ACAD10Q6JQN1 1059 aa21.86■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 GDPD4Q6W3E5 623 aa21.86■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 CRELD1Q96HD1 420 aa21.86■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 CLCA2Q9UQC9 943 aa21.86■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa21.85■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa21.85■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 INSIG1O15503 277 aa21.85■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 IGSF6O95976 241 aa21.85■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 ALPPL2P10696 532 aa21.85■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 RABIFP47224 123 aa21.85■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 ANO6Q4KMQ2 910 aa21.85■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa21.85■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 VPS36Q86VN1 386 aa21.85■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 PARGQ86W56 976 aa21.85■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 DNAAF5Q86Y56 855 aa21.85■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 FAM174AQ8TBP5 190 aa21.85■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 IFT43Q96FT9 208 aa21.85■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 APOLD1Q96LR9 279 aa21.85■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa21.85■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 TTYH3Q9C0H2 523 aa21.85■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 SCUBE2Q9NQ36 999 aa21.85■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 KLF15Q9UIH9 416 aa21.85■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 RP1P56715 2156 aa21.85■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 AREL1O15033 823 aa21.84■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 MBD3O95983 291 aa21.84■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 NME1P15531 152 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 TNFAIP3P21580 790 aa21.84■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 SERINC3Q13530 473 aa21.84■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 TTC7BQ86TV6 843 aa21.84■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 ARHGEF26Q96DR7 871 aa21.84■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 SYT11Q9BT88 431 aa21.84■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa21.84■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 NLGN3Q9NZ94 848 aa21.84■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 TMEM63CQ9P1W3 806 aa21.84■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 LHX3Q9UBR4 397 aa21.84■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa21.83■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 K7ESM1 405 aa21.83■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 SCAMP1O15126 338 aa21.83■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 MMP20O60882 483 aa21.83■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 PIGNO95427 931 aa21.83■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 CCDC172P0C7W6 258 aa21.83■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 CKMT1AP12532 417 aa21.83■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 IGFALSP35858 605 aa21.83■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 TPI1P60174 286 aa21.83■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 RAD51Q06609 339 aa21.83■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 PARP15Q460N3 678 aa21.83■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 ZSCAN30Q86W11 494 aa21.83■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 RBFAQ8N0V3 343 aa21.83■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 DENND6BQ8NEG7 585 aa21.83■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 RFFLQ8WZ73 363 aa21.83■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 U3KQA8 63 aa21.83■■□□□ 1.09
USP40-215ENST00000484528 A0A087WV48 116 aa21.82■■□□□ 1.08
USP40-215ENST00000484528 NEMP2A6NFY4 417 aa21.82■■□□□ 1.08
USP40-215ENST00000484528 LRRC53A6NM62 1247 aa21.82■■□□□ 1.08
USP40-215ENST00000484528 WASH4PA8MWX3 477 aa21.82■■□□□ 1.08
USP40-215ENST00000484528 H3BM21 787 aa21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms