RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476502.1

TRBV1-201, Transcript of T cell receptor beta variable 1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene TRBV1, Length 284 nt, Biotype TR V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV1-201ENST00000476502 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 CYP4B1P13584 511 aa3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 PRF1P14222 555 aa3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 TNFAIP3P21580 790 aa3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 HNF1BP35680 557 aa3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 LIFRP42702 1097 aa3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 RPS6KA3P51812 740 aa3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 ID2Q02363 134 aa3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 ZNF91Q05481 1191 aa3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 STIM1Q13586 685 aa3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 SMTNL2Q2TAL5 461 aa3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 FBXO43Q4G163 708 aa3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 ATG16L1Q676U5 607 aa3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 RETSATQ6NUM9 610 aa3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 MAATS1Q7Z4T9 603 aa3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 KLBQ86Z14 1044 aa3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 SCAIQ8N9R8 606 aa3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 SKA1Q96BD8 255 aa3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 ZBTB10Q96DT7 871 aa3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 ZFYVE19Q96K21 471 aa3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 SYT17Q9BSW7 474 aa3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 TRIM31Q9BZY9 425 aa3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 ACAD9Q9H845 621 aa3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 WASH6PQ9NQA3 447 aa3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 THSD1Q9NS62 852 aa3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 TMEM45AQ9NWC5 275 aa3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 UTS2RQ9UKP6 389 aa3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 LAMP3Q9UQV4 416 aa3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 GDAQ9Y2T3 454 aa3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 RAI2Q9Y5P3 530 aa3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 SCINQ9Y6U3 715 aa3.3□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 CEP162Q5TB80 1403 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 KANK1Q14678 1352 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 F8W810 466 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 UGDHO60701 494 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 TOMM40O96008 361 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 FCGR2AP12318 317 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 CD72P21854 359 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 DDIT3P35638 169 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 CASP2P42575 452 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 EFNA5P52803 228 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 NR1H2P55055 460 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 VAMP2P63027 116 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 SLC12A1Q13621 1099 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 ANKRD1Q15327 319 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 AP5B1Q2VPB7 878 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 ENTPD8Q5MY95 495 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 C10orf76Q5T2E6 689 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 C17orf99Q6UX52 265 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 LRIG3Q6UXM1 1119 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 KAT2BQ92831 832 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 NEUROD6Q96NK8 337 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 GPR63Q9BZJ6 419 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 NOD2Q9HC29 1040 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 NLKQ9UBE8 527 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 ICKQ9UPZ9 632 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 CRYL1Q9Y2S2 319 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 CLDN16Q9Y5I7 305 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 ARHGEF5Q12774 1597 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 DUOX2Q9NRD8 1548 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 PXDNQ92626 1479 aa3.28□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 NPHP3Q7Z494 1330 aa3.28□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 DYTNA2CJ06 578 aa3.28□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 CBY3A6NI87 242 aa3.28□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 RHODO00212 210 aa3.28□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 SYN3O14994 580 aa3.28□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 TSPAN3O60637 253 aa3.28□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 LDHCP07864 332 aa3.28□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP3.28□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 CPA2P48052 419 aa3.28□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 PRELPP51888 382 aa3.28□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 ARHGAP8P85298 464 aa3.28□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 IL13RA2Q14627 380 aa3.28□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 DLGAP5Q15398 846 aa3.28□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 TWIST1Q15672 202 aa3.28□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 TAF12Q16514 161 aa3.28□□□□□ -1.88
TRBV1-201ENST00000476502 SYTL3Q4VX76 610 aa3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms