RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 TMCC1O94876 653 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 GCP02774 474 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 TFP02787 698 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 ADRB2P07550 413 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 ADRB1P08588 477 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 CD63P08962 238 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 MCM3P25205 808 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 GCH1P30793 250 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 CENPAP49450 140 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 KRTAP10-2P60368 255 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC18A2Q05940 514 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 OLIG2Q13516 323 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 IRF3Q14653 427 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 PPP2R5BQ15173 497 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 SYTL3Q4VX76 610 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 RAB41Q5JT25 222 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 AAGABQ6PD74 315 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 CRIP3Q6Q6R5 217 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 DBX2Q6ZNG2 339 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 TICAM1Q8IUC6 712 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC34Q96HJ3 373 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 YME1L1Q96TA2 773 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 PIMREGQ9BSJ6 248 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 IKZF4Q9H2S9 585 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC6A13Q9NSD5 602 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 ABI3Q9P2A4 366 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 CARD8Q9Y2G2 431 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 SESN1Q9Y6P5 492 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 KAT6AQ92794 2004 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A1W2PQ09 198 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 DPPA5A6NC42 116 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 SCAMP1O15126 338 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP4.86□□□□□ -1.634e-37■■■□□ 18.2
RABGGTB-207ENST00000470201 WNT1P04628 370 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 PCNAP12004 261 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 KRT10P13645 584 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 EDN2P20800 178 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 DPP6P42658 865 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 TUBA4AP68366 448 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 PMPCAQ10713 525 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 FGFBP1Q14512 234 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 ALG11Q2TAA5 492 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 ALG10Q5BKT4 473 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 ALG10BQ5I7T1 473 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 GPR139Q6DWJ6 353 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 TBC1D26Q86UD7 250 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 TRIM74Q86UV6 250 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 TRIM73Q86UV7 250 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 TMC8Q8IU68 726 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 KIAA2013Q8IYS2 634 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 MAP4K1Q92918 833 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 BBS4Q96RK4 519 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 PLK2Q9NYY3 685 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 MORF4L1Q9UBU8 362 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM96BQ9Y3D0 163 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A087X1B8 175 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A1W2PRQ8 180 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 C2CD4BA6NLJ0 364 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 CDRT15L2A8MXV6 281 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 FOXO6A8MYZ6 492 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 IFNL4K9M1U5 179 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 RHODO00212 210 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 RB1P06400 928 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 CLTBP09497 229 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 PRR35P0CG20 571 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 CTPS1P17812 591 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 RYKP34925 604 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 GPR12P47775 334 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 CLDN2P57739 230 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 TTC39AQ5SRH9 613 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 FCRLBQ6BAA4 426 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 ISM2Q6H9L7 571 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 DDIASQ8IXT1 998 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 ADGRF4Q8IZF3 695 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM185AQ8N0U4 392 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 CADM3Q8N126 398 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 DPP10Q8N608 796 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 C8orf58Q8NAV2 365 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC191Q8NCU4 936 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 SGCDQ92629 289 aa4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms