RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	HLA-DPA1	P20036	260 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	CA4	P22748	312 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	ADRA1D	P25100	572 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	CNTF	P26441	200 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	RGR	P47804	291 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	LMAN2	Q12907	356 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	LRRC14	Q15048	493 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC1A5	Q15758	541 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	ALG14	Q96F25	216 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	APOPT1	Q96IL0	206 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	SERAC1	Q96JX3	654 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	RANBP9	Q96S59	729 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	GOLGA8R	I6L899	631 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	INSIG1	O15503	277 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	TYROBP	O43914	113 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	ZWINT	O95229	277 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	CD160	O95971	181 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	FGF1	P05230	155 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	TCF3	P15923	654 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	PAM	P19021	973 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	CR2	P20023	1033 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	GP5	P40197	560 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC18A1	P54219	525 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	CDK18	Q07002	472 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	MPP2	Q14168	576 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	GALNT3	Q14435	633 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	FYB2	Q5VWT5	728 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	RNF43	Q68DV7	783 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	RNF135	Q8IUD6	432 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	APCDD1	Q8J025	514 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	SGSM3	Q96HU1	749 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF778	Q96MU6	729 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	CPNE1	Q99829	537 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	EPN3	Q9H201	632 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	NOD2	Q9HC29	1040 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	LHX3	Q9UBR4	397 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	EPOP	A6NHQ4	379 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	CES1	P23141	567 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	CD70	P32970	193 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	CCNF	P41002	786 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	SCNN1B	P51168	640 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	SEC24C	P53992	1094 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	RHOA	P61586	193 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	MROH9	Q5TGP6	573 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	CNPY4	Q8N129	248 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	BANP	Q8N9N5	519 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	GDAP1	Q8TB36	358 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	ITFG1	Q8TB96	612 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	RBBP8	Q99708	897 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	TREX1	Q9NSU2	369 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	PSAT1	Q9Y617	370 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	COL4A3	Q01955	1670 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	HMX2	A2RU54	273 aa		12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	GMNC	A6NCL1	334 aa		12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	PAPLN	O95428	1278 aa		12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	NDST3	O95803	873 aa		12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	EPO	P01588	193 aa		12.41	□□□□□ -0.42

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