RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 UQCRBP14927 111 aa18.52■□□□□ 0.56
SYNE4-204ENST00000465425 TAS2R39P59534 338 aa18.52■□□□□ 0.56
SYNE4-204ENST00000465425 POU4F1Q01851 419 aa18.52■□□□□ 0.56
SYNE4-204ENST00000465425 ART3Q13508 389 aa18.52■□□□□ 0.56
SYNE4-204ENST00000465425 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
SYNE4-204ENST00000465425 PCSK7Q16549 785 aa18.52■□□□□ 0.56
SYNE4-204ENST00000465425 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
SYNE4-204ENST00000465425 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
SYNE4-204ENST00000465425 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
SYNE4-204ENST00000465425 LSMEM2Q8N112 164 aa18.52■□□□□ 0.56
SYNE4-204ENST00000465425 PHC3Q8NDX5 983 aa18.52■□□□□ 0.56
SYNE4-204ENST00000465425 STON2Q8WXE9 905 aa18.52■□□□□ 0.56
SYNE4-204ENST00000465425 CASP10Q92851 521 aa18.52■□□□□ 0.56
SYNE4-204ENST00000465425 RCN3Q96D15 328 aa18.52■□□□□ 0.56
SYNE4-204ENST00000465425 GPR78Q96P69 363 aa18.52■□□□□ 0.56
SYNE4-204ENST00000465425 CDRT15Q96T59 188 aa18.52■□□□□ 0.56
SYNE4-204ENST00000465425 POMKQ9H5K3 350 aa18.52■□□□□ 0.56
SYNE4-204ENST00000465425 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
SYNE4-204ENST00000465425 BCAP29Q9UHQ4 241 aa18.52■□□□□ 0.56
SYNE4-204ENST00000465425 FBXO5Q9UKT4 447 aa18.52■□□□□ 0.56
SYNE4-204ENST00000465425 TRPC5OSA6NMA1 111 aa18.51■□□□□ 0.55
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SYNE4-204ENST00000465425 NPHS1O60500 1241 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 JUNP05412 331 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 FESP07332 822 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 CD1EP15812 388 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 FLOT2Q14254 428 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 SH2D4BQ5SQS7 431 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 MANEALQ5VSG8 457 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 ICA1LQ8NDH6 482 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 SGF29Q96ES7 293 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 MRGPRX2Q96LB1 330 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 FAM192AQ9GZU8 254 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 ZBTB26Q9HCK0 441 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 TREX1Q9NSU2 369 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 TBC1D13Q9NVG8 400 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 MPP6Q9NZW5 540 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 E9PAM4 449 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 H3BNX3 289 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 CPB1P15086 417 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 CHRNA4P43681 627 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 RAB27AP51159 221 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 DLG1Q12959 904 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 MMEL1Q495T6 779 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 NEPROQ6NW34 567 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 RSPH1Q8WYR4 309 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 MARK4Q96L34 752 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 PKMYT1Q99640 499 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 EFCAB1Q9HAE3 211 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 GTSE1Q9NYZ3 720 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 NUDT5Q9UKK9 219 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 M0QZQ0 153 aa18.5■□□□□ 0.55
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SYNE4-204ENST00000465425 AHCYL1O43865 530 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 THOP1P52888 689 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 CSHL1Q14406 222 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 FAM83EQ2M2I3 478 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 RANBP10Q6VN20 620 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 LRRC49Q8IUZ0 686 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 PGAM4Q8N0Y7 254 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 HEXDCQ8WVB3 486 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF385DQ9H6B1 395 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 CLIC5Q9NZA1 410 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 PADI3Q9ULW8 664 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 PSMD13Q9UNM6 376 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 TADA2AO75478 443 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 CD52P31358 61 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 HERC3Q15034 1050 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 TSTD2Q5T7W7 516 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 TRIM67Q6ZTA4 783 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 PQLC1Q8N2U9 271 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 KDM1BQ8NB78 822 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 CALML6Q8TD86 181 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 WDR41Q9HAD4 459 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 ARHGEF37A1IGU5 675 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 HEATR9A2RTY3 570 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM233B4DJY2 109 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 TXNDC9O14530 226 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 PEX1O43933 1283 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF623O75123 536 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 VCLP18206 1134 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 WNT3AP56704 352 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 TUSC3Q13454 348 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 PIGGQ5H8A4 983 aa18.49■□□□□ 0.55
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