RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 TSPAN6O43657 245 aa20.85■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 UGT2B4P06133 528 aa20.85■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 CCNCP24863 283 aa20.85■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 MAOBP27338 520 aa20.85■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 GARSP41250 739 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 NR2C2P49116 596 aa20.85■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 AP1S1P61966 158 aa20.85■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 BCL2L1Q07817 233 aa20.85■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 PDK1Q15118 436 aa20.85■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 AGBL4Q5VU57 503 aa20.85■□□□□ 0.93
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IMP4-209ENST00000462357 TRIM69Q86WT6 500 aa20.85■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 CCDC50Q8IVM0 306 aa20.85■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 KATNAL2Q8IYT4 538 aa20.85■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 CCNYQ8ND76 341 aa20.85■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 ACRBPQ8NEB7 543 aa20.85■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 FATE1Q969F0 183 aa20.85■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 KLHL32Q96NJ5 620 aa20.85■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 AMACRQ9UHK6 382 aa20.85■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 C16orf96A6NNT2 1141 aa20.84■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 AP1G1O43747 822 aa20.84■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 MAFKO60675 156 aa20.84■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 KRT10P13645 584 aa20.84■□□□□ 0.93
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IMP4-209ENST00000462357 MMP13P45452 471 aa20.84■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 SCNN1BP51168 640 aa20.84■□□□□ 0.93
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IMP4-209ENST00000462357 C21orf59P57076 290 aa20.84■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 COPS2P61201 443 aa20.84■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 RPS21P63220 83 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 RACK1P63244 317 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 IRX4P78413 519 aa20.84■□□□□ 0.93
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IMP4-209ENST00000462357 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa20.84■□□□□ 0.93
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IMP4-209ENST00000462357 TMEM139Q8IV31 216 aa20.84■□□□□ 0.93
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IMP4-209ENST00000462357 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 UBL4BQ8N7F7 174 aa20.84■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 OR6K2Q8NGY2 324 aa20.84■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 EXD1Q8NHP7 514 aa20.84■□□□□ 0.93
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IMP4-209ENST00000462357 TSGA13Q96PP4 275 aa20.84■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 FERMT1Q9BQL6 677 aa20.84■□□□□ 0.93
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IMP4-209ENST00000462357 SUV39H2Q9H5I1 410 aa20.84■□□□□ 0.93
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IMP4-209ENST00000462357 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa20.84■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa20.84■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 ARHGAP33O14559 1287 aa20.83■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 MATN3O15232 486 aa20.83■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 ELP6Q0PNE2 266 aa20.83■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 SGCGQ13326 291 aa20.83■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 STAT4Q14765 748 aa20.83■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 TFDP3Q5H9I0 405 aa20.83■□□□□ 0.93
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IMP4-209ENST00000462357 LRRC8AQ8IWT6 810 aa20.83■□□□□ 0.93
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IMP4-209ENST00000462357 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa20.83■□□□□ 0.93
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IMP4-209ENST00000462357 HYOU1Q9Y4L1 999 aa20.83■□□□□ 0.93
IMP4-209ENST00000462357 HEY1Q9Y5J3 304 aa20.83■□□□□ 0.93
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IMP4-209ENST00000462357 IGHV4-34P06331 123 aa20.82■□□□□ 0.92
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IMP4-209ENST00000462357 ITKQ08881 620 aa20.82■□□□□ 0.92
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IMP4-209ENST00000462357 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP20.82■□□□□ 0.92
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IMP4-209ENST00000462357 HORMAD1Q86X24 394 aa20.82■□□□□ 0.92
IMP4-209ENST00000462357 CPNE8Q86YQ8 564 aa20.82■□□□□ 0.92
IMP4-209ENST00000462357 SERAC1Q96JX3 654 aa20.82■□□□□ 0.92
IMP4-209ENST00000462357 EXOC2Q96KP1 924 aa20.82■□□□□ 0.92
IMP4-209ENST00000462357 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
IMP4-209ENST00000462357 CAPN10Q9HC96 672 aa20.82■□□□□ 0.92
IMP4-209ENST00000462357 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
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