RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453030.5

GARNL3-210, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 536 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-210ENST00000453030 FAM72AQ5TYM5 149 aa11.86□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 MANEALQ5VSG8 457 aa11.86□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 SMYD5Q6GMV2 418 aa11.86□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 FAM72DQ6L9T8 149 aa11.86□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 PCSK4Q6UW60 755 aa11.86□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 VPS36Q86VN1 386 aa11.86□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 FAM72BQ86X60 149 aa11.86□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 ZNF354CQ86Y25 554 aa11.86□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 LSMEM2Q8N112 164 aa11.86□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 ZNF843Q8N446 348 aa11.86□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 NETO2Q8NC67 525 aa11.86□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 DENND6BQ8NEG7 585 aa11.86□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 OR2AP1Q8NGE2 309 aa11.86□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa11.86□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 VCPIP1Q96JH7 1222 aa11.86□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 KLHL32Q96NJ5 620 aa11.86□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 IL12RB2Q99665 862 aa11.86□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 C11orf70Q9BRQ4 267 aa11.86□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 ASCL3Q9NQ33 180 aa11.86□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 THSD1Q9NS62 852 aa11.86□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 OR12D3Q9UGF7 316 aa11.86□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 NEU3Q9UQ49 428 aa11.86□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 PMS2P1A4D2B8 440 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 CASC3O15234 703 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 RAMP2O60895 175 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 DXOO77932 396 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 GFPT2O94808 682 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 LRIG2O94898 1065 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 GSRP00390 522 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 RHOQP17081 205 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 SDC4P31431 198 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 MAPKAPK2P49137 400 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 THOP1P52888 689 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 ERVPABLB-1P60509 514 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 PFN3P60673 137 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 C1orf61Q13536 156 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 NR0B2Q15466 257 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 TCEA2Q15560 299 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 ARL13BQ3SXY8 428 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 PRRT3Q5FWE3 981 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 PERM1Q5SV97 790 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 FOXR1Q6PIV2 292 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 ZSCAN30Q86W11 494 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 NLRP14Q86W24 1093 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 PHACTR4Q8IZ21 702 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 CCDC185Q8N715 623 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 JOSD2Q8TAC2 188 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 SLC30A5Q8TAD4 765 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 GPT2Q8TD30 523 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 RXFP2Q8WXD0 754 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 RAB7BQ96AH8 199 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 TBC1D31Q96DN5 1066 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 LRRC61Q9BV99 259 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 MAGEB5Q9BZ81 275 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 CLSTN2Q9H4D0 955 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 TMEM51Q9NW97 253 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 TMEM248Q9NWD8 314 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 TAB2Q9NYJ8 693 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 HPCAL4Q9UM19 191 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa11.85□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 ERVH48-1M5A8F1 160 aa11.84□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 MMP20O60882 483 aa11.84□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 GCATO75600 419 aa11.84□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 TMCC1O94876 653 aa11.84□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 PLA2G2AP14555 144 aa11.84□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 ADRA1BP35368 520 aa11.84□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 KLK7P49862 253 aa11.84□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 UCNP55089 124 aa11.84□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 FMO1Q01740 532 aa11.84□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 CFHR1Q03591 330 aa11.84□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 CCDC14Q49A88 953 aa11.84□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 ARCQ7LC44 396 aa11.84□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 SLC35F3Q8IY50 421 aa11.84□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 CXorf40AQ8TE69 158 aa11.84□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 FAM172AQ8WUF8 416 aa11.84□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 ARHGEF26Q96DR7 871 aa11.84□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 EXOC2Q96KP1 924 aa11.84□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa11.84□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa11.84□□□□□ -0.51
GARNL3-210ENST00000453030 STK33Q9BYT3 514 aa11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms