RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-222ENST00000449504 TSPAN6O43657 245 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 RASGRP1O95267 797 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 CPNE6O95741 557 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 NR3C1P04150 777 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 FYNP06241 537 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 SETSIPP0DME0 302 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 PRF1P14222 555 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 MPSTP25325 297 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 L1CAMP32004 1257 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 IGFALSP35858 605 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 IRAK1P51617 712 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 OR1D5P58170 312 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 YPEL5P62699 121 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 KRT83P78385 493 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 MC1RQ01726 317 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 ALG11Q2TAA5 492 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 CERCAMQ5T4B2 595 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 SYPL2Q5VXT5 272 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 ANKS6Q68DC2 871 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 FBXL22Q6P050 247 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 PMF1Q6P1K2 205 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 FAM173BQ6P4H8 233 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 MACC1Q6ZN28 852 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 TAF8Q7Z7C8 310 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 FAM129CQ86XR2 697 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 TP53INP2Q8IXH6 220 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 SCML4Q8N228 414 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 CCDC112Q8NEF3 446 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 DENND6BQ8NEG7 585 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 GPR156Q8NFN8 814 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 STARD8Q92502 1023 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 SEMA4DQ92854 862 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 CENPTQ96BT3 561 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 TCTN2Q96GX1 697 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 BTN2A3PQ96KV6 586 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 CCDC74BQ96LY2 380 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 C7orf25Q9BPX7 421 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 NUDT22Q9BRQ3 303 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 EFHD1Q9BUP0 239 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 DPEP2Q9H4A9 486 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 COX16Q9P0S2 106 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 VANGL2Q9ULK5 521 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 SMC3Q9UQE7 1217 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 OR51B4Q9Y5P0 310 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 KCNMB2Q9Y691 235 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 WASF2Q9Y6W5 498 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 ITPR2Q14571 2701 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 TCP11X1B4DZS4 312 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 O00370 1275 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 AP1G1O43747 822 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 MMP20O60882 483 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 TNFP01375 233 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 PDGFAP04085 211 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 VDRP11473 427 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 KRT13P13646 458 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 GGCXP38435 758 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 ABL2P42684 1182 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 SRP54P61011 504 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 B4GALNT1Q00973 533 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 NNTQ13423 1086 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 BIRC2Q13490 618 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 ERV3-1Q14264 604 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 NADK2Q4G0N4 442 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 C14orf28Q4W4Y0 310 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 LRRC73Q5JTD7 316 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 DCAF12Q5T6F0 453 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 C22orf39Q6P5X5 142 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 SLC9A9Q8IVB4 645 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 NLGN4XQ8N0W4 816 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 AGBL5Q8NDL9 886 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 SLC35F5Q8WV83 523 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 RNF31Q96EP0 1072 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 EEF2KMTQ96G04 330 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 CTRCQ99895 268 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 HEPHQ9BQS7 1158 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 ST7Q9NRC1 585 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 OCIAD1Q9NX40 245 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.29□□□□□ -1.24
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