RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428858.1

TTC28-AS1-209, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 565 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KRIT1O00522 736 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 INSIG1O15503 277 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KCNN4O15554 427 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC7A4O43246 635 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BNIP3LO60238 219 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OPHN1O60890 802 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SOCS5O75159 536 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF217O75362 1048 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GCATO75600 419 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GJB3O75712 270 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DNTTP04053 509 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C5AR1P21730 350 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ITGB7P26010 798 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CALRP27797 417 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PAFAH1B1P43034 410 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PSMD8P48556 350 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FNTAP49354 379 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SCNN1BP51168 640 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GDF10P55107 478 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MAXP61244 160 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RAD51Q06609 339 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NIPAL4Q0D2K0 466 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ANGPT1Q15389 498 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 P3H1Q32P28 736 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF805Q5CZA5 627 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TTC27Q6P3X3 843 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NCEH1Q6PIU2 408 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GDPD4Q6W3E5 623 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 WDR5BQ86VZ2 330 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LONP2Q86WA8 852 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF567Q8N184 647 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM71DQ8N9W8 422 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR6K2Q8NGY2 324 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ECHDC3Q96DC8 303 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SIPA1Q96FS4 1042 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PPP1R16AQ96I34 528 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SPATA13Q96N96 652 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AGAP3Q96P47 875 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FCRL5Q96RD9 977 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SEMA3CQ99985 751 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AP1M1Q9BXS5 423 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HDAC8Q9BY41 377 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC25A51Q9H1U9 297 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC6A17Q9H1V8 727 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C10orf88Q9H8K7 445 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NOD2Q9HC29 1040 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NT5MQ9NPB1 228 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SEPT10Q9P0V9 454 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SARDHQ9UL12 918 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FZD4Q9ULV1 537 aa8.26□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 A0A1W2PQ67 120 aa8.25□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AXIN1O15169 862 aa8.25□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MID1O15344 667 aa8.25□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FZD6O60353 706 aa8.25□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PHF2O75151 1096 aa8.25□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NEBLO76041 1014 aa8.25□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IL1BP01584 269 aa8.25□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 UGT2B4P06133 528 aa8.25□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MMP2P08253 660 aa8.25□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SERPINF2P08697 491 aa8.25□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SP9P0CG40 484 aa8.25□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SERPINA4P29622 427 aa8.25□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GKP32189 559 aa8.25□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC8A1P32418 973 aa8.25□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CD68P34810 354 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DRD3P35462 400 aa8.25□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 P2RY2P41231 377 aa8.25□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TPMTP51580 245 aa8.25□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SUOXP51687 545 aa8.25□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 METAP1P53582 386 aa8.25□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SKOR1P84550 965 aa8.25□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DSC2Q02487 901 aa8.25□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LMNB2Q03252 620 aa8.25□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BCL2L1Q07817 233 aa8.25□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DMWDQ09019 674 aa8.25□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TUBB2AQ13885 445 aa8.25□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IHHQ14623 411 aa8.25□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MAP7D1Q3KQU3 841 aa8.25□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ARSIQ5FYB1 569 aa8.25□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa8.25□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa8.25□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa8.25□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa8.25□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms