RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 RNF135Q8IUD6 432 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 ARMC5Q96C12 935 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 GPR22Q99680 433 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 KCNK13Q9HB14 408 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 HEATR9A2RTY3 570 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 CLDN11O75508 207 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 RHOCP08134 193 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 DLDP09622 509 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 NCALDP61601 193 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 TNK2Q07912 1038 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 C10orf107Q8IVU9 208 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 CNTN4Q8IWV2 1026 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 BHMTQ93088 406 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 TADA1Q96BN2 335 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 PTPRSQ13332 1948 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 CNPP09543 421 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 PAMP19021 973 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 OXCT1P55809 520 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 ZXDBP98169 803 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 OCRLQ01968 901 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 GALNT3Q14435 633 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 USP10Q14694 798 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 MBLAC2Q68D91 279 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM33Q9UPN9 1127 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 KCTD3Q9Y597 815 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 KIAA1671Q9BY89 1806 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 CHD7Q9P2D1 2997 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 CBX4O00257 560 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 AURKAO14965 403 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 DCTN3O75935 186 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 RGRP47804 291 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 ARFIP2P53365 341 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC15Q0P6D6 951 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 STX3Q13277 289 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF460Q14592 562 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 MFSD6LQ8IWD5 586 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 IFT43Q96FT9 208 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 PRKD2Q9BZL6 878 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 A0A1B0GVM2 712 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 TCAF2A6NFQ2 919 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 TGM5O43548 720 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 TGDSO95455 350 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 PIRTP0C851 137 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 INSCQ1MX18 579 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 TSTD2Q5T7W7 516 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 NECAB2Q7Z6G3 386 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 OR13J1Q8NGT2 312 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 C7orf26Q96N11 449 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 COPG2Q9UBF2 871 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 BUD23O43709 281 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 ITM2AO43736 263 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 EFCAB14O75071 495 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 SNNO75324 88 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 F11P03951 625 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 MPOP05164 745 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 MYL2P10916 166 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 PPM1AP35813 382 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 CYP4F8P98187 520 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 NEPROQ6NW34 567 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 SPNS2Q8IVW8 549 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 MUC3BQ9H195 1237 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 IL21Q9HBE4 155 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 MYO7AQ13402 2215 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 LILRB3O75022 631 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 HAUS5O94927 633 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 IL1BP01584 269 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 CLEC14AQ86T13 490 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 KIF2BQ8N4N8 673 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF398Q8TD17 642 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 NSMCE3Q96MG7 304 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 NOD2Q9HC29 1040 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 HEY2Q9UBP5 337 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 KDELR3O43731 214 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 DNAJC6O75061 913 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 CDK18Q07002 472 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 PTPRCAPQ14761 206 aa23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms