RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419364.1

SIX3-AS1-201, SIX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SIX3-AS1, Length 844 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KLHL11Q9NVR0 708 aa13.56□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MYO1AQ9UBC5 1043 aa13.56□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa13.56□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa13.56□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa13.56□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 IGLON5A6NGN9 336 aa13.55□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 C1SP09871 688 aa13.55□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MIPP30301 263 aa13.55□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PBX1P40424 430 aa13.55□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ABL2P42684 1182 aa13.55□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FGL2Q14314 439 aa13.55□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ACAP1Q15027 740 aa13.55□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CYTH1Q15438 398 aa13.55□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CA9Q16790 459 aa13.55□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GCNT7Q6ZNI0 430 aa13.55□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 Q6ZSR6 202 aa13.55□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RFX8Q6ZV50 586 aa13.55□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa13.55□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa13.55□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TTC7BQ86TV6 843 aa13.55□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 VPS36Q86VN1 386 aa13.55□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 IQCDQ96DY2 449 aa13.55□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PEBP4Q96S96 227 aa13.55□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP13.55□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa13.55□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TMEM131Q92545 1883 aa13.55□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ARHGAP42A6NI28 874 aa13.54□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SDC3O75056 442 aa13.54□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SERPING1P05155 500 aa13.54□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CDK4P11802 303 aa13.54□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZBED6P86452 979 aa13.54□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GRM3Q14832 879 aa13.54□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HGSNATQ68CP4 663 aa13.54□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DHRS13Q6UX07 377 aa13.54□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NETO2Q8NC67 525 aa13.54□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ASB12Q8WXK4 309 aa13.54□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 VOPP1Q96AW1 172 aa13.54□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 IFT43Q96FT9 208 aa13.54□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 BMFQ96LC9 184 aa13.54□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SLC39A8Q9C0K1 460 aa13.54□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DKK3Q9UBP4 350 aa13.54□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LHX3Q9UBR4 397 aa13.54□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CAPN11Q9UMQ6 739 aa13.54□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ITM2BQ9Y287 266 aa13.54□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ACACBO00763 2458 aa13.53□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 POM121BA6NF01 834 aa13.53□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 J3KR12 359 aa13.53□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FPGTO14772 594 aa13.53□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 AREL1O15033 823 aa13.53□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RAD51BO15315 384 aa13.53□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PRAMEF11O60813 436 aa13.53□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LRCH4O75427 683 aa13.53□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CKMT2P17540 419 aa13.53□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ERCC2P18074 760 aa13.53□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DGKAP23743 735 aa13.53□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PCK1P35558 622 aa13.53□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RABIFP47224 123 aa13.53□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HCAR3P49019 387 aa13.53□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SUOXP51687 545 aa13.53□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DNAJC3Q13217 504 aa13.53□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HS1BP3Q53T59 392 aa13.53□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CPLX3Q8WVH0 158 aa13.53□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TSC1Q92574 1164 aa13.53□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 EXOC2Q96KP1 924 aa13.53□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa13.53□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PDFQ9HBH1 243 aa13.53□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GGT7Q9UJ14 662 aa13.53□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TPRP12270 2363 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 INSIG1O15503 277 aa13.52□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SPINT1O43278 529 aa13.52□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RFPL3O75679 317 aa13.52□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PALMO75781 387 aa13.52□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TIMP2P16035 220 aa13.52□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 XPAP23025 273 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ACADVLP49748 655 aa13.52□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NFKBIBQ15653 356 aa13.52□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa13.52□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 BOLA3Q53S33 107 aa13.52□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LRRC73Q5JTD7 316 aa13.52□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 AFMIDQ63HM1 303 aa13.52□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TMPRSS12Q86WS5 348 aa13.52□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa13.52□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SLC25A45Q8N413 288 aa13.52□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LZTR1Q8N653 840 aa13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.3 ms