RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416728.3

PAF1-202, Transcript of PAF1 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component, humanhuman

TSL 2

Gene PAF1, Length 1,383 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAF1-202ENST00000416728 MAPK15Q8TD08 544 aa14.65□□□□□ -0.06
PAF1-202ENST00000416728 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PAF1-202ENST00000416728 NTAN1Q96AB6 310 aa14.65□□□□□ -0.06
PAF1-202ENST00000416728 KLHL32Q96NJ5 620 aa14.65□□□□□ -0.06
PAF1-202ENST00000416728 SELENOOQ9BVL4 669 aa14.65□□□□□ -0.06
PAF1-202ENST00000416728 MAGEB5Q9BZ81 275 aa14.65□□□□□ -0.06
PAF1-202ENST00000416728 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa14.65□□□□□ -0.06
PAF1-202ENST00000416728 ADAM22Q9P0K1 906 aa14.65□□□□□ -0.06
PAF1-202ENST00000416728 GGT7Q9UJ14 662 aa14.65□□□□□ -0.06
PAF1-202ENST00000416728 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa14.65□□□□□ -0.06
PAF1-202ENST00000416728 RAI2Q9Y5P3 530 aa14.65□□□□□ -0.06
PAF1-202ENST00000416728 U3KQA8 63 aa14.65□□□□□ -0.06
PAF1-202ENST00000416728 DOCK9Q9BZ29 2069 aa14.65□□□□□ -0.06
PAF1-202ENST00000416728 EPHB6O15197 1021 aa14.64□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 BUB1O43683 1085 aa14.64□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 KDELR3O43731 214 aa14.64□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 USP12O75317 370 aa14.64□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 CSO75390 466 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 TMCC1O94876 653 aa14.64□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 THOP1P52888 689 aa14.64□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 PFN3P60673 137 aa14.64□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 RAD51Q06609 339 aa14.64□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 TPRG1LQ5T0D9 272 aa14.64□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 CDKAL1Q5VV42 579 aa14.64□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 GDPD4Q6W3E5 623 aa14.64□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 TTC7BQ86TV6 843 aa14.64□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 LSMEM2Q8N112 164 aa14.64□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 LMX1AQ8TE12 382 aa14.64□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa14.64□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 LGMNQ99538 433 aa14.64□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 IL12RB2Q99665 862 aa14.64□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 KLF15Q9UIH9 416 aa14.64□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 IGSF10Q6WRI0 2623 aa14.64□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 CPED1A4D0V7 1026 aa14.63□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 AREL1O15033 823 aa14.63□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 SPINT1O43278 529 aa14.63□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 UNGP13051 313 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 GPD1P21695 349 aa14.63□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 EPHB2P29323 1055 aa14.63□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 GSCP56915 257 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 GABREP78334 506 aa14.63□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 TLE3Q04726 772 aa14.63□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 PTP4A2Q12974 167 aa14.63□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 PTK2BQ14289 1009 aa14.63□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 SYCP1Q15431 976 aa14.63□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 CDKN3Q16667 212 aa14.63□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 DEFB133Q30KQ1 61 aa14.63□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 EFHC2Q5JST6 749 aa14.63□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 SLFN11Q7Z7L1 901 aa14.63□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 VPS36Q86VN1 386 aa14.63□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 SPACA3Q8IXA5 215 aa14.63□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 C3orf20Q8ND61 904 aa14.63□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 ZNF248Q8NDW4 579 aa14.63□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 BTN2A2Q8WVV5 523 aa14.63□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa14.63□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 PCDHB18PQ96TA0 734 aa14.63□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa14.63□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 TTYH3Q9C0H2 523 aa14.63□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 SPASTQ9UBP0 616 aa14.63□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 SALL4Q9UJQ4 1053 aa14.63□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 ANKRD62A6NC57 917 aa14.62□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 TK2O00142 265 aa14.62□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 TPP1O14773 563 aa14.62□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 TM7SF2O76062 418 aa14.62□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 DXOO77932 396 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 IGSF6O95976 241 aa14.62□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 CALB1P05937 261 aa14.62□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 LSSP48449 732 aa14.62□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 RHOAP61586 193 aa14.62□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa14.62□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 LRRC73Q5JTD7 316 aa14.62□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 SCYL2Q6P3W7 929 aa14.62□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 GUSBP11Q6P575 273 aa14.62□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 WDR59Q6PJI9 974 aa14.62□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 GPR155Q7Z3F1 870 aa14.62□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 RBFAQ8N0V3 343 aa14.62□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 NEK11Q8NG66 645 aa14.62□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 CXorf40AQ8TE69 158 aa14.62□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 SLC39A7Q92504 469 aa14.62□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 VOPP1Q96AW1 172 aa14.62□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 CENPTQ96BT3 561 aa14.62□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa14.62□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 SIK3Q9Y2K2 1263 aa14.62□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 TRPM6Q9BX84 2022 aa14.62□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PAF1-202ENST00000416728 DOCK4Q8N1I0 1966 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms